Selection 1

Selection 2

Selection 3

All selections

Taxon : Methanobacteria

Informations

Name	Methanobacteria
Rank	class
# topoisomerases	8

Lineage and sub-taxa

Lineage	Archaea > Euryarchaeota > Methanobacteria
Sub-taxa

Topoisomerases

Select all	Name	Family	Sequence
	(1570) DNA topoisomerase 1 [Methanobrevibacter ruminantium M1]	3	MHEVIISEKPKSAEKIAKALSPNAQKKKYNRKINYWEFEENGKKTTVLSAVGHLYSLTSASSRDRLGFDLTWVPAYEVEKQKYTRDYINAIKKLSKGADKFVHACDYDVEGTLIGYNALKYACGNNAEAKASRMKFSTLTKKDIVEAYNTMRDIDIRQVDHGIARHMLDYYYGMNISSALMKAVRASSSRFISLSAGRVQTPTLSILVDREKEIQSFVPEPYWMIKAKSDYDIIADHVEGKIFDEERAKKIYADCQGADADVTSVKVTESIRKPPIPFNLGGLQSEAHTVFGFSPKRTQVAAQNLYVGGYTSYPRTSSQKLPESLDFKNIFAGLAKDPEFKKHIFDLPAKLKPNEGKKTDAAHPAIHPTGVLPSNLSADEAKIYSLIVYRFISVFSENSKLETMKVNLKVADEKFTFSRKRVSYEGWLKHYPFKKQENDAFPPINKGDQLKIHKILVEEKETKPPARYNEASLIKELEKRELGTKATRADIVAKLYDRKYIEGKKIEVKPLGINIIDTLNEYCKDLTSEELTREFERELEGIDTDKYTKEQILENGEKEVKTILAEINQNKKQIGEKLYGAYQETNVVGECSCGGKLIKRYSPRTKNTFVGCSNFPKCKVTYSLPKGANMLKKTCPTCGLPMISIKKASGKGRDHVCLDSNCGKDVSRRQAPEVVGKCPECGKDLLKRSGRYGEFVGCSGFPRCRFTCSVDELNNLGKDKNKEDVKENKGVSKKIVRSEAK
	(1782) DNA topoisomerase 1 [Methanothermobacter marburgensis str. Marburg]	3	MHEVIICEKPKSSEKIAGALFPDAERKKYRKVSYWEYSEGNKRVTIVSAVGHLYSLRPSKPGEEHFFDLEWAPLHEIDKKKNYVKDYLNVIKKFAAGADRYIHACDYDIEGTLIGFNAIRYGCGEDALQKTVRMKFSTLTREEIQSAYEKPIELDCGQVDSGAARHILDFIFGVNISRSLMKSVKEATNRFIKLSAGRVQTPTLAILVEREKEIREFEPVPYWIIQAELESGIVAESRRGKIFQRPLVDEVLERCSGSDASVRGVKVRDTVRKPPVPFDLGSLQSEAYRVFGFSPKKTQTIAQNLYTEGYTSYPRTSSQKLPESIGYRKILDRLSEDPRFGAHIEGLSEPLKPHEGKKVDDAHPAIHPTGLLPSDLSSDERKIYELIVHRFISVFGEDAVLQTMRVDLEIGGEEFSFSRKRVSKRGWMDSYPYTRIEDEVFPDISEGDVMGVVGVSTLEKETKPPARYNEASLIRELEKRGLGTKSTRADIIAKLYDRKYIEGKKIRVSPLGENIIDTLTKYCEKITSEELTRQFERELEEIMEGKISRDRVVDEAIEEVKSILSDIERNMKDIGRDLYKAYQDSRVVGECPACGRNLVIKYSPRNKSTFVGCSGYPDCRTVYSLPRGASVLKSRCEKCGLPMISYGRPRQRACLDPSCGKKESKGEEIVGKCPECGSDLIKRSGRYGEFVGCKGFPRCRFTCSVDDVPAA
	(653) DNA topoisomerase 1 [Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H]	3	MRSLSGKMHEVIICEKPKSSEKIAGALFPDAMKKKHGKVSYWEHVEGDKRVTIVSAVGHLYSLRPRQSNEEHFFDLEWAPIHEIDKKKGYVKDYLNVIRKFAAGADRYIHACDYDIEGTLIGFNALKYGCGEEALRKTSRMKFSTLTREEIQRAYKNPIEVDYGQVDSGAARHILDFIFGVNISRSLMKSVKAATNRFIKLSAGRVQTPTLAILVEREKEIRDFKPVPYWIIRAELGEGIIAESKRGKIFKRELVDSILEKCQGSDAEVKDVRVRDTIRKPPVPFDLGTLQSEAYRVFGFSPKKTQTIAQNLYTEGYTSYPRTSSQKLPESIGYEKILKNLAKNPRFGVHIERLRGPLKPHEGKKEDDAHPAIHPTGLLPSELSKDEKKVYDLIVHRFISVFGEDAILQTMKVELEIGEEEFSFSRKRVSKAGWMESYPYTKMEDEEFPEISGGDSLAVRSVSADERETKPPARYNEASLIRELERRGLGTKSTRADIIAKLYDRKYIEGKKIRVSPLGENIIDTLTRYCEKIISEELTRQFERELEDIMRGKISKDRVIDEAITEVRSILSDIEENLRDIGKELYRAYQDSRVVGECPACGGKLVIKYSPRNRSTFVGCSSYPDCRTVYSLPRGASVLKSLCEKCGLPMISYGRPRQRACLDPKCGKKKSEVEEVVGKCPECGSDLIKRSGRYGEFVGCKGFPKCRFTCSVDEVPEG
	(617) DNA topoisomerase 1 [Methanobacterium paludis]	3	MHEVIICEKPKAAEKISSALSKGAAKKHYKKVPYYEFEENGKKTTVLTAVGHLYSLAPKDKKQDKLFDVEWVPLYEKDKKKKYVKNYIDAIKKLSKDADTFVHACDYDIEGTLIGYNALKYACGDESLKNVMRMKFSTLTDEDILKAYKKPMELDFKQVDSGIARHVLDFFFGVNMSKHLTDSVMKATKRYIQLSAGRVQTPTLSILVDREKEIKEFIPVPYWLIKADLDVTGVKEGITADHKKGKILEKKDADAILVECKGKDAVITEVNLRKTTKTPPFPFDLGSLQSEAYGVFGFSPRKTQQIAQNLYTEGYTSYPRTSSQKLPKSIGYDKILKKLSYSSAFGNHVAQLKKPYKPNEGKKTDEAHPAIHPTGVLPKELSTDYRKLYELIVYRFISVFGENATLETMKTTLTIGKEEFNFSRKRMSKMGWMGHYPFRKIEEDYFPTMNKGETLNVKEVRAEDKETKPPARYNQASLIRELEKRGLGTKSTRANIIDILFSRKYVEGKKITVNKLGEQLIDTLRKYSKKITSEELTREFETKLEGIMEGKDKKDKIIDEARVEVSSILDDIEKNKLKIGEELYKSYRESRVVGKCKCGKNLILIDSPRGSTFVGCSGYPECKSTYSMPRGATVLKTTCEECGLPMISFGKPRQRACLDPKCGKDGREPTNEVVGKCPDCGSDLIKRSGRYGEFIGCSGFPKCRFTKSIDDDGGKTAAKTTGAPKKTVAKKAATKKSATKKSATKKSATKKSATKKSATKKSATKKSATKKSATKKSATKKNAKKTK
	(1679) DNA topoisomerase 1 [Methanobrevibacter smithii ATCC 35061]	3	MNEVIICEKPKSAEKIAKALSSKAKKNVFNKKVKYWTLERDGKDITVLSAVGHLYSLTPDNPKDKVYFDLHWAPLFEIDKKYKNYTKDYVRAIKKYAKDADSYIHACDYDIEGTLIGYHALKYGCGDDALKKSSRMKFSTLTKKDIVEAYENRIPIDRHQVDSGVARHILDFYFGVNISKALMKSVSAAKKRFLKLSAGRVQTPTLSILVDREKEIKKFVPKPYWLIKALLDGEIEADHVDGKIFDKTRAEEIFSNCENSDAAVDKIKYSNSTTKPPVPFNLGGLQSEAYNVFGFSPKKTQTIAQSLYTAGYTSYPRTSSQKLPESLDFKSIFLQLSKNSEFRTHISALPAKLKPNEGKKEDAAHPAIHPTGILPDKLDKDELKIYELIVYRFISVFFEAATFETMSTTLDIGGEKFKFRRRRVTHKGWLEHYPFKKIDNEEFPDVKEGDSIIVKEIVSEEKETKPPARYNQASLIKELEKRELGTKATRADIIDKLYDRKYITGNKIEVNQLGENIIDTLSEYCSNLTSEELTRDFENKLEGIDNDKATRESVVAEGEKEVKVILGDIDKNKVKIGSQIYDAYQESNIVGKCKCGGNLVKKYSPKNKSTFVGCSNYPDCKATYSVPKGANFLKKTCKTCGLPIISFGKPRQHACLDPNCGKENTKPREMKVVGVCPSCGKELIKRSGRYGEFVGCRGFPKCRFTCSLDELKDKVQ
	(32) DNA topoisomerase 1 [Methanothermus fervidus DSM 2088]	3	MTLVNEVIICEKPQAAEKIANSLSSSTKKKKYKNVPYWEIKKTDKKILVVPAVGHLYTLAPSNKKKDYFFDLEWTPVYLVDKKRKYIKNYIDAIKKLGKKADRYIHACDYDIEGTLIGYNVLRYCIGKKSLKKSLRMKFSTLTKRDIRKAYENLTSIDYGQVNGGITRHFLDFLFGVNISRALMNSIQNSTKKFVKLSAGRVQTPTLSILVDREREIKKFKPKTYWVIEAKTKFFTAKFKEQKIFDKNKALKIVKECKNKNAIVKSVKITKRYRNPPVPFDLTTLQSEAYRLFGFSPRKTQSLAQNLYLGGYISYPRTSSQKLPPSIDYEKIFEGLSKNPKFERYISKLSKPFKPYEGKKTDEAHPAIHPTGVMPKNLNEDESKLYELIVHRFIAVFADKAKIANLRGVLSINDYEFIFNKQKIIKEGWMSFYPYTSVKNEEFPEIKEGDKLKIEKIIKEEKKTKPPARYTAASLIKEMEVRGLGTKSTRAEIISALYDRKYIEGRKIKVKPLGIKIINILKKYCKKITSEKLTREFEKKIKRIIKGEINKENVITEAKNEVKDILNSIEDKQKEIGEELYNAYKKSKIIGKCKCGGNLIIRYSQKYKKRFVGCSNYPACKVTYSLPKNAIILESKCKRCGLPLISYGNPRRVACLNPKCGKKIDEEKIVGKCPKCGNDLIIKSGRYGKFVGCKGFPKCKYVRSI
	(1117) Reverse gyrase [Methanothermus fervidus DSM 2088]	6	MYRAIYKGMCPNCGKEIDDSRLNAKNPCKSCVEKKLQCEDYHELLEKIEEYLKENNNLYGWKEIYELHRDLKDIENLFEKATNSKFWNIQKTWFIRLIKGESFPIIAPTGVGKSIFGIFASLYYALKNKKSYIIVPTTSLVLQTVEKIKKFMEKTQIKVNLAFYHGKLKEKEKMKNKIENDDFDILVTTSQYLAINFDILKNKKFDFIFIDDVDAFLKSSRNIDRSLILLGFSEEIIEKGWELIKLKERGPKRNSEQIKKIENKIKEFKEKNKIGNLVVASATIKVKNKRIKIYRELLNFEITGEVPTIRNMVDSYIKTDEKIEKHLVKLLNILGNGGIIFVPTDQGIEKAKKIENYLKNNGFKVKLVSSADKTGIKEFKEGKIDYLVGVATYYGVLVRGLDIPERVRYTIFTGVPKHRFVINLDSPRLYSIIILLRVLIDVLKGNYKRKAESLYTKLQKIPKYKIKEIEKKLENGHADSRITKIYDDSVKFVRKIFKKEEIRKKIFSNEFLSMEIQNNKLCIKFPDLRTYIQASGRASRLFAGGITHGLSVVIIDDEKVFEGLKRQYKWQFQKHEFKAFEKLKLKKILNKIDEDRKKVKAIKKHGKFEIKNIVKSALFIVESPNKARTIANMFGNIGKRRIGRLTVYETNIGNRILMIVATGGHIFDLVNDEGFHGIKIENGHFIPIYDTIKRCRECGNQFVNNNGSTCPKCKSNDIIDTFENILVMRELAQEVDEVLIGTDPDVEGEKIAWDVMNVLSPYTSNLKRVEFHEVTRSAILKAIKEASKINIKRVEAQIVRRIEDRWIGFELSQKLWEEFDNTYLSAGRVQTPVLGWIIKRYNDFRKSETYFTKLTLENRMEIILEGKKETDYLEVKKVNKEEKDINPNPPYTTDTLLTDASRILGFPTTKTMRLAQDLFEMGFVTYIRTDATYVSDVGNIIARDYIKNEIGEKYFKARKWGKEGAHECIRPTRPIDSEKIIQLIRNNVIRTTKKLTSDHLRLYNLIFKRFMASQMTPVNLHYQKIVLGIDDEEIEIEGYTDIIDPGWTKIVRLPMKKLPEVKEGQKIKIKEIKTWKAPKISLFTEGDVIEKMKKSGIGRPSTYSKIVNTLLDRRYVIKTKLKKKLLPTKLGVNVYNYLIHTYEKLVSEERTRELEKVMDEIEEGSRNYQEVLNSIYEEIKQFV
	(1263) DNA topoisomerase 1 [Methanosphaera stadtmanae DSM 3091]	3	MSELIICEKPKVAEKVAKALSDSPVKNSYKRVPYYEFTNGNGTKITVLSAVGHLFSLKAKNKKDKRLFDVEWVPLSETDKSKKYVKNYIDTIKKFSKDADRFIHACDYDTEGTLIGFNALRYICGEDSIDKSFRMKFSALTKKDLIESYSNAYPLKEDKSWVDSGETRHVLDFLFGVNISKSMTDSVLNVTNRYVQLSAGRVQTPTLAILTEREKEIQKFIPEPYWLIKAKLQKSIVADHKKGKIFDKKEVDAILKNCKGKDATVEKITNRKTKKDLPVPFELGTLQSEAYAQFGFTPRKTQQIAQNLYVEGYTSYPRTSSQKLPESLGLPNILSQLSKHPKYKDKISQLEQPYKPHEGKKTDEAHPAIHPTGTLPKDISEDYQKIYDLITYRFISIFGKPAEMESIKVELDIGGEPFSFSRQRISKEGWLSLDPYQYKKVKNEEFPEIKEGQTTKAKVASEEKETKPPARYNQASIIRELEKRGLGTKSTRANIVSILYTRKYVEGKKIEVSQLGQQIINTLEKYSERITSEQMTREFETDISNIKENEITEATVIEDAKKELNGILDSIDDNIEDIGKELYGAYEQSRVVGKCGCGGNLIIISSPRGGKFVGCSNYPDCKKTYSLPAGANVLKTTCEKCGLPLISYGKPRQRACLDFECANGGQKSTNDVVGECPDCGKDLIKRMGRFGEFIGCTGFPKCRFTSSIDDFEKSKKESEKKD

Family distribution

Taxonomy tree

Methanobacteria