Toggle navigation
TopoIBase
Data
Taxonomy and VLD families
Downloads
My selection
Upload to selection
Selection 1
Selection 2
Selection 3
Tools
Blast
MUSCLE
VLD
About
How to use
Acknowledgements and references
Contact
Tests
Search more
Download
fasta
tsv
Download
Blast
Muscle
VLD
Add to selection
Selection 1
Selection 2
Selection 3
All selections
Taxon : Methanococci
Informations
Name
Methanococci
Rank
class
# topoisomerases
18
Lineage and sub-taxa
Lineage
Archaea
>
Euryarchaeota
>
Methanococci
Sub-taxa
Topoisomerases
Select all
Name
Family
Sequence
(1236) DNA topoisomerase 1 [Methanococcus vannielii SB]
3
MTGLIICEKPNVAKKIAEALGKPKKKSHNSVPYYELERNGEDIIVASAVGHLYTLQEKEKTKFGDYPVYDIEWVPASTLDDKKYIQKYIDTLKKVSKEASKFYVATDFDIEGELIGYHALSHACGQKNAHRLRFSSLTKKEIIKSFENPNQIDFGLVDAGDSRHKIDWYFGINVSRALMQAVSSAKRWKTLSTGRVQGPALAFLVDKEIEIKNFIPTPYWVLEAVLDNNLKALHELEKFTDEKRAKEAYEKVKNEKEALVTEIKKTLKSIPPNVPFDLGALQREAHNVFRFSPKKTQEVAQKLYEKGYCSYPRTSSQKLPDDKAYMDEVLKNLSKNKEYSKYIELILSEGRKPVDGKKDDPAHPAIHAVDVPKENLPDDELKLYELIARRTIALYLDDAKREYSKISLEINGEPFKLNGSRTIEEGWHELYYFTKFDEIELPTLKKKDLLRINEIAFEEKETKPPKRYTMASIIKELEKRTLGTKATRADILEKLTKRGYVIDDGSLTVTELGIGVTETLRKFCPEIVEETLTRDLENKLELIQDKKIKKETVIKETKDKLTKILGEFKLKEKEVGNELVEKLDSTNRSMQVIGKCKCGGDMIIIRTKGKKRFVGCSNYPECEITFPIPQKGRIKVINEVCKTCENPIIGLDSIKICVNPDCKTRISEEDRKEMEKAALEEKSCPKCGGKLSIKKGPYGVFRGCENYPKCKYTEKLNGESNEKEVIGKCPKCGNDLLKRKGRFGDFIGCSNYPKCRYTEKIEKKKEGDLEDKIEVTKEKVKAKETLKSEKNLDKTLDNPKPKRTKTASKKKKEELKN
(1006) Reverse gyrase [Methanocaldococcus vulcanius M7]
6
MIPMIYKGMCPNCEDEIRSERLEVGVCEKCLPIDKKLEKLELCKNLKKEKTLKNLEKYCSVWNEFKKFEEFVKRLGFELLSIQKMWAKRVLKNKSFSIVAPTGVGKSFFGIIMSLYLTKKGKKCYIILPTTLLVKQTHDRILSLIEKCKLNINVISYHSDLSTKEKKEAKEKIENGDYDLLITTSNYLAKNDINNKFDFIFVDDVDSLLKASKNIDKTLKLLGFDEELIKEAYKIIYLIKIGKIEEALKKREELKRKVSNINHGCLIIASATGKSYGDKVKLYRELLDFEIGFGMNKLRDVEDIYDEEFKKEEVLEYIKIFGSGGLVFVPIDYGVEKAEEIEKYLLENNIKAKLIYSKDKKGFEEFRKGEIDVLIGVASYYGVLVRGLDMPERVRYAVFYGIPKFKIKLKEYIDKLIEKGVLKENIDIENKSEDEIRHIVKEKLKMKNFSIKLENGEYFILIPDVKTYIQASGRTSRMTEFGLTKGASIVLVDDKDIFEYLRKYMLFMYESEFKKIDEVDIRELIKKIDEDREKIKSGRSSGKTPDLLKSVLMVVESPNKARTIANFFGKPSVRKIKNRNVYEVCVGDLNLLITASGGHVFDLVTKEGFYGVKIEDNIYIPIYASIKKVNGEQFTDQKDLEDVIKQLMEKGEKITNIIDAKDNIEIIREIADEVDALFIATDIDTEGEKIGYDIALNALPFNSEIYRVGFNEITKRAILRAVESFKKGEELSLDENKVKGQIVRRIEDRWIGFRLSQKLWEVFNKNYLSAGRVQTPVLGWIIERYNEHKIKVPYLSLKLEGDIYIGKIWEGEFDKEEVSVETTTYEKELPPMPPFTTDTLLEEATKRYHIGTDEIMSIAQDLFELGLCLTPDTHIVLGDGRIKTIEEIVKSREKKEILSLDLDRKSIICDKIISFWEIKFSGNLKKITLQNNYEIKATPDHHILTLKDGRLKWIPAKNIKEGDYVVMPFNYNYKIRRSHPPSKIFEKIKKIVEIDNFNDVREPEFWYNLGLLFGNDRLSLQGSEKEHLVEELFSLKEDYINAFIAGYLDARGTFLKRGKEINIATFSKNKSILEKIGIYLHSIGILTMIQEHNGYFLVIDNKFLTTFTEKIVKYTKTKNLKEFCRTVIENKNKNKNVKKSNKKIKVGNIYNDVIFIKVKKVEDLFYDGYVYDLSIKCNENFISNGIISHNCTYHRTSSTRVSIDGMKVAREYLKLNNLEHYIKNRDYFMEGAHECIRPTKPMDTDELIEFLRENNIKLTKNHIKIYDLIFRRFIASQTKEAILEYEEIYIKDLDEKIEGYVDIKFDGWSRFYPLKLKKLPKIEKNSLKVLEKKLIKVPKVPLYDEGEVIKLMKERGIGRPSTYAQIIKKLLDRKYVIKSKDKNKLIPTKLGIEVYNFLIENYPHLISEERTRDLEEIMDKIERGEVDYLEVLKVLHEEILSIE
(1862) DNA topoisomerase 1 [Methanocaldococcus vulcanius M7]
3
MTALIICEKPSVAKKIANALGKPKKKSIDGVPYYELERDGKKIIVASAVGHLFTLVENENNEFGKYPIFDIKWVPASVDKGKEYVNKYIKALKKLSKEADEFYIATDWDIEGELIGYHALKYCCGREKAKRMRFSSLTKKEIVKAFENPDEIDYGLVDAGESRHILDWYFGINLSRALMNAIRAVNRWKTMSVGRVQGPALAFLTERELEIKKFIPKPYWVIEALLKDNLKAIHEKEKFWDEKEAKSVYEKIKDEKSAKVVEIKKTKRRIKPLPPFDLGTLQREAYSYFKISPKETQEIAQRLYERALISYPRSSSQKLPKDRKYLEDILNIIKNHPIYGKWAEKILEKNLKPVEGKKDDPAHPAIHIVDIPKEELSEKEKKIYDLIARRTLSAFWDNAEREYLNVKIDIKGEKFKLSGSRTVKEGWHEIYYFPKFDEIELPPLKKNDIIKVEKITITRKETQPPKRYTVASIIKELEKRGLGTKCLTAKTLIKVKIDNEIKYMEIEKLFELLNEKYKEKNIELAVNNKDIKCFSFNYKDEVESSFKFISRRKLEKDESVYRIEFEDGSFIEATEEHPILIYDNGDFRYVKANDLKKGMKTISFTDNKDFITKTISNIRKINYNGYVYDIINSEYLNFIANNIVVHNSTRAEIIDKLIKRGYVVDDGSLKVTDLGISVIETLKRFCPEIVDEKMTRDLEEKLEKIQFRKIKKDEVLDEAENKLRKILEEFKEKEEDVGTYLIKNLDATNKKAKIVGKCPKCGGDLILIRHKKSRFVGCSNYPECDVNYSLPDKGRIKIPNKVCNACKSPILKIGDREICINPECPLKQVEIKEEDRICPKCGAELILKKGVYGAFYGCSNYPKCKYTEPINKKEKEIVGKCPKCGGDLVVREGKFGKFIGCSNYPKCKYTEKLKENEKKENKKGEDKT
(1088) DNA topoisomerase 1 [Methanotorris igneus Kol 5]
3
MVALIICEKPSVAKKIAEALGKPKKKSIYGVPYYELERNGKKILVASAVGHLFTLVEKKEGKFGEYPVFDIDWVPASIEEGKKYVENYIKALKKLSKEADEFYVATDWDIEGELIGYHALYYCCGKKNAKRMRFSSLTKKEIVKAFENPDTIDFGLVDAGDSRHKVDWYFGINVSRALMEAIRAVKRWKTMSTGRVQGPALAFLVERELEIKRFVPKPYWVISALLDEKLNATHEKEKFWDEKEANQVYKKIKDVKEGIVVEVKKRKKKIKPNPPFDLGTLQREAYRIYKFSPKKTQEIAQRLYEKSLCSYPRTSSQKLPKDKKYLEDVLSIIKNHPIYGKYAERILKENLKPIEGKKEDPAHPAIHIVDIPKEKLSEEEEKIYDLIARRTLAAFWDDAEREYCNITIDIGGEKFKLSGSRTVKEGWHEIYYFTKFDEIELPPLKKNEKIKVEKINIERKETKPPKRYTVASIIKELESRKLGTKCLTPNTLIKVEIDNIIKYIKIENLFELLNDRFKDGNVEFAINNKNIKCFSYDTDEIKSIFKYISKRKLEKNESVYKIEFEDGSFIEVTEEHPILIYDGDGEFKYIRAKDLKKGMKTISSIKYDDKEGDVICTWEKFIEICNEKSKLYGISEDIGKIREKLGMSKYKFAKKYGLSCSSVWKYEKNKRIPIYLFKKLDLKKPNYIASTNKNVIIKNPFPLKISSSLVRILAHLIGDGSIDKEKIKRENCYDFRYHNTNIDLIKQFVEDIERVFGIKLTIKKAKKRKNQKLKYYVQVPSVVGRIISILFKEVIEKNAPKIPKEFYPEFIGALFDDEGCAIEKEGKAFISNTNLELLKDVKEMLLELGIKSRIDEKQFKLFIKGRKNIQKFLNIIPFISVDKKQKLINALSNKYKWKDCSVVKKEKEIIKVLGLYGAIDLNELSKKTKLPASVVREYIKEFIKNGIVEEIVSDNKKIVYTLKIPPHKTFYRYIGEKVINKDFITKTISNIKKINYNGYVYDIINSEYSNFIANNIVVHNSTRAEIIDKLISRGYVVDDGSLRVTDLGIAVIETLKKFCPEIIDEKMTRDLEEKLELIQSGKIKKEDVLKEAEEKLREILKKFKEKEKEIGKELVSKIDSTNKKLKTIGKCKCGGDLVIIRTKDKKRFVGCTNYPECNITYSLPKKGRIKVLNETCESCGLPVIGIDGQKLCINPECPSKMPKENIEDLKESINNGKKICPKCGGKLVIKNGIYGAFLGCENYPKCKYTEKIKKNNGEVVGKCPKCGGDLVKKNGKYGEFIGCSNYPKCRYTEKFKK
(962) Reverse gyrase [Methanotorris igneus Kol 5]
6
MVPIIFKNMCPNCHSDIESLRLDKGLTCKNCMEDDSVSNICKYLAEKNTLKALEDYCKLKNELKELEDVAERCGFKLLSIQRMWAKRVLKNKSFSIVAPTGVGKSVFGMITAIYFATKNKKSYIILPTTLLVKQTYEKIINMANKAGVEVNVVAYHSELSSEEKRVAKEKIEKKDYNILITTSNYLSKNPIDDKFDFVFIDDVDAFLKASKNIDKSLKLLGFSDEIIKKAYNILYLIRKKKIEDALKEREKLKEMISKINHGCMIVASATGKSYGDKVKLYRELLDFEIGYGMSKLRDVEDIYDENLSMEKILEYIKIFGDGGIIFVPIDYGLKKAEEIEEFLIKNGIKAKLIHSKDKKGFEEFKNGEIDVLIGVASYYGVLVRGLDIPERIRYCIFYGVPKFKIDLEETLKKENENISIEGLNEEELMELVKNTLKIKNFSLRKEDNKYYLLIPDVKTYIQTSGRTSRMTENGLIKGASIVLVDDAEVFEGLKKYMLFMYEGEFKRIDEIDVEKLIEKIDEDRRKLKETKEKNKVPDLLKSALMVVESPNKARTIANFFGKPSVRRINNKKVYEVCIGDWNLIITASGGHIFDLVTKEGYHGVLIGNNSYIPIYGTIKRVNGEQFVDEKNIEELIKRIKEKTNENIVIHDAKENIEILRDLASEVDAVFIATDIDVEGEKIGYDIYLNLKPFNKNIFRIGFNEITKRAIMNAIKIVKEGKSEELSLDENKVRAQVVRRIEDRWIGFELSKKLWDAFNNTYLSAGRVQTPVLGWIIDRYNEYQIKVPYLYLKLEDDISFGTIVDDETAKKIKDKDYVDVEVNVYEKDIYPNPPFTTDTLLEEATKRFGLSSDEVMKIAQELFELGLTTYHRTSSTRVSLDGMRVAREYLEFNDMLDYLKNREYYMEGAHECIRPTKPMDTSELIEFIKNNNIYLTKDHIKIYDLIFRRFIASQMKECKVEYEEITIKDLDTKVEGYTNIIYDGWTKIYNLKLRKLPKIEKNTLKIIEKSIRKVPKVSLYDEGEIIKLMKERGIGRPSTYAQIVKKLFDRKYVLKSKDKGKIIPTKLGIEVYNYLKNNYYNLICEERTRELENVMDKIEKGEVEYIKVLDELLNEIKSIT
(845) Reverse gyrase [Methanocaldococcus infernus ME]
6
MPVPMIFKEMCPNCGGEISSERLTIGVCENCLPEDIRLEKLELCKKIEVKNLKNYCKVWREFKEFEDFVKSLGYKLLSIQKMWAKRVLKNKSFSIVAPTGVGKSFFGVLISLYLASKGKRCYIILPTTLLVKQTYERITKIIEEKNLKINVVAYHSELKNREKREAKEKIENNEFDILITTSSYLTKNMPKAKFDFIFVDDVDALLKSSKNIDRTLMLLGFSEEHINLASKIVFLIRIGKFEDAMKLREELKEKIKDVKHGCLVIASATGKSYGDRVKLYRELLNFEVGFGMNKLRDVTDLYDDKLSVEEIVRYVKKLGDGGLIFVSMDYGVEKAKEIEERLLEEGVKAKLIHSKDKKGFEDFKEGKLEVLIGVASYYGVLVRGLDMPERVRYSLFYGIPKFKIKLREYVRKLVEEGKLKEEIEIEGKSLEEIENIVREKLKIRNFSLREEDDIYLLLPDVKTYIQASGRTSRMTEFGLTKGLSIVLSDDKKLLEYLSKYMIFMYESEFKHVSEVNLEEIIKEIDEDRERLRREKRKKEVPDLLKSVLMVVESPNKARTIASFFGKPSVRKINNRNIYEVCVGDLNLIITASGGHVFDLVTKEGFYGVKIEDNLYIPIYCSIKKVDGEQFTDQKDIEELIKENVNFMDSKENIEIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIALNVMPFNNSIYRVGFNEITKRAILRAVEAFKNKEKLELDENKVKGQVVRRIEDRWIGFRLSQKLWEVFGKNYLSAGRVQTPVLGWIIERYNEHREKVNLLSLRLEEDIYVSKVFDGEFDREEVNIEVKIYERKIEPQPPFTTDTLLEEATKRFNLSVDEVMSIAQDLFELGLCTYHRTSSTRVSLDGMRVAKEYLKLNGLEDYLKNREFFMEGAHECIRPTKPMDTEELIEFIKENNIRLTKNHIKVYDLIFRRFMASQMKEVLVEYEEIYIKELDEKIEGYIEVKFDGWSKLYWLKLKKLPRVEKDKLKVLEKSVRRIPKVPLYDEGEVVKLMKERKIGRPSTYAQIIKKLLDRGYVIKSKDKGKLVPTKLGIEVYNYLITNYPELISEKRTRELEEIMDKIENGEIDYIEVLNELYKEILSIT
(1773) DNA topoisomerase 1 [Methanocaldococcus infernus ME]
3
MILIIAEKPSVAKKIANALGKAKKKKIYDVPYYEVDYNGKKIVVASAVGHLFTLVEKNKSFSYPTFEIKWAPAYIEKGKSYVKNYIRALKELSKYADEIYIATDYDIEGELIGYHALKFCCGRDKGKRMKFSSLTKREIIKAFENPISMDYGLVDAGESRHIVDWYFGINLSRALMHAVKALNDWKILSIGRVQGPTLYFLAEREKEIKEFKPKPYWILEAYLKNLKAIHEKEKFWDEEEAKKIYEKVKDAKYGEVVKVERRVSKIKPPVPFDLGTLQREAYNYFKFSPKKTQEIAQSLYEKGLCLHPDTLILLPDGVKKIKELKEEGEVLCLNHNLKLTKSRYKLLKRTVREKLIKITLNDGTELITTREHPILVYRDKLLFVPSERLKEKEQIITLGHQNKELSLDNYLINEDLKRISEGDVYISKIKKIEEIEYEGEVYDLVVDKFHNFIANGIVVHNCSYPRTSSQKLPKDWSYLENILKTLKNSEYWKFAERIIEEKRKPIEGKKDDPAHPAIHVVDYPKNKEELSKEELKVYDLIARRTLSAFWDEVEREHINAKISINDELFKASGSKTVKEGWHVIYHFPTFEELNLNLKEGEKVKVEKIKLVKKETKPPKRYTLSSIIKELEKRNLGTKATRAEIVDKLIKRGYIKVSKNGSLEVTDLGASIVEVFKRFCPEIVDEKLTRELEDKLENIQMKKINKDLVLEEAKKRLIEVLKKFKEKEVEIGKNLTNKEVVGTCPRCGSPLVVKEGKYGKFIGCTNFPKCKFTKSLE
(461) DNA topoisomerase 1 [Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661]
3
MAEIMTALIICEKPSVAKKIANALGKAKKKSIDGVPYYELERDGKKIIVASAVGHLFTLVEKENKEFGFYPVFDIKWVPASVDKGKEYVNKYIKALKKLSKDADEFYIATDWDIEGELIGYHALKYCCGREKAKRMRFSSLTKKEIVRAFENPDEIDYGLVDAGESRHILDWYFGINLSRALMNAIRAVNRWKTMSVGRVQGPALAFLTERELEIKKFIPKPYWVIEALLKDNLKAIHEKEKFWNEKEAKNVYEKIKDEKSAKVVEIKKTKRKLKPLPPFDLGTLQREAYSYFKISPKETQEIAQKLYENALISYPRTSSQKLPKDRKYLEDILNIIKNHPVYGKWAERILKENLKPVEGKKEDPAHPAIHIVDIPKEELSEKEKEIYDLIARRTLAAFWDNAEREYLNVKIDIKGEKFKLSGSRTVKEGWHEIYYFPKFDEIELPPLKKNDIIKVEKITITRKETQPPKRYTVASIIKELEKRGLGTKATRAEIIDKLIKRGYVIDDGSLKVTDLGISVIETLKRFCPEIIDEKMTRDLEEKLEKIQFRKIKKDDVLDEAEKRLRKILEEFKKKEEDIGIYLIKNLDATNKKAKIVGKCPKCGGDLILIRHKKGRFVGCSNYPECDVKYSLPDKGRIKIPNKVCDACKSPILKIGDREICINPECPLKQVEVKEEDRICPKCGAKLILKKGVYGAFYGCSNYPKCKYTEPINKKEVVGKCPKCGGDLVVREGKFGKFVGCSNYPKCRYTEKLKLNEKEEK
(909) Reverse gyrase [Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661]
6
MIPMIYKEMCPNCNGEITSERLAIGVCEKCLKEENVFEKLKLCEKLREEKTLKNLKDYCIIWNEFKEFEEFVKDLGFELLSIQKMWAKRVLKNKSFSIVVPTGVGKSFFGILMSLFLAKKGKRCYIILPTTLLVKQTYEKISSLTEKNNLNIRVVAYHSELSTKEKKEVKERIENNDYDVLITTSNYLTKNMPKCKFDFVFVDDVDALLKASKNIDRTLKLLGFDEEIINEAYKIIYLIKIGKIEDAMKKREILKKKISKIKHGCLIIASATGKSYGDRVKLYRELLDFEIGFGMNKLRDVVDIYDEEFSKEKILEYIKLFGSGGIVFVSIDYGVEKAQEIEKYLLENNIKAKLIHSKDKKGFDDFREGKIDVLIGVASYYGVLVRGLDMPERVRYAIFYGIPKFKIRLKEYINSLKEKGELKEDINIEGKTEEEIRQIITEKLKIKNFSLRKEDDEYLLLIPDVKTYIQASGRTSRMTEFGLTKGASIVLVDEKEIFEALKKYMLFMYESEFKRIDEVNLEELIKKIDEDREKIKVGRAKGKVPDLLKSVLMVVESPNKARTIANFFGKPSVRKINNRNVYEVCIGDLNLIITASGGHVFDLVTKEGFYGVKIENNLYIPIYTSIKKVNGEQFTDQKDLEELIKQLMEKGERVNAMDAKENIEIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIAINALPFNRNIYRVGFNEITKRAILKAVESFKKGEELSLDENKVKGQVVRRIEDRWIGFRLSQKLWEVFNKNYLSAGRVQTPVLGWIIERYNEHKIKVPYLSLKLENDIYIGKIWEDEFDKDEVEVEVKVYEKEIPPLPPFTTDTLLEEATKRFGLSTDEIMSIAQELFELGLCLTPDTYVVLGDGRIETIEDIVNAKERNVLSLDLDNLSIKIDTAIKFWKLRYNGNLSKITLSNNYELKATPDHCLLVLRDNQLKWIPAKDIKENDYIAMPFNYKVERKPISLLNLLKYLDITDVLIEFDENSTIFEKIAEYIRNNIKTSTKYKYLRNRRVPLKYLIEWNFDLDEIEKEAKYIYKSVAGTKKIPLFKLDERFWYFAGLVLGDGSIQDSKIRIAQTPLKDVKSILDETFPFLHNWISGNQVIISNPIIAEILEKLGMRNGKLNGIIFSLPESYINALIAGYFDTDGCFSLLYDKKAKKHNLRMVLTSKRRDVLEKIGIYLNSIGILNTLHKSREVYSLIISNKSLETFKEKIAKYLKIRKEAFINGYKTYKKEHEERFECDLLPVKEVFKKLTFEKGRKEILKDSKIHIENWYKEKTNNIPREKLKTVLRYANNSEHKEFLEKIVNGDISFVRVKKVENIPYDGYVYDLSIKHNQNFISNGVISHNCTYHRTSSTRVSLDGMRVAREYLKLNNLEDYLKNREYFMEGAHECIRPTKPMNTDELIEFLKENNIKLTKNHIKVYDLIFRRFIASQMKEAVVEYEEIYIKDLDEKVEGYVDIKFDGWSRIYNLKLKKLPRIEKSSLKVLDKKLRKIPKVPLYDEGEVVKLMKERGIGRPSTYAQIIKKLLDRGYVVKSKDKNKLIPTKLGIEVYNYLINNYPHLISEERTRELEEIMDKIENGEVDYIEVLKALHEEILSIR
(1047) Reverse gyrase [Methanothermococcus okinawensis IH1]
6
MIPIIYKEMCPNCNGEITSERLEIGVCERCLKEEKVFEKLELCKKLREEHTLNNLKNYCNTWKEFKEFNKFTKSLGYELLSLQKMWAKRILKNKSFSIVAPTGVGKSFFGILISLFLAKKGKKCYIILPTTILVRQNYEKILSLIENKLNINIIAYHSELSAKEKKKAKENIKNNNYDLLITTSNFLVKNIPNTAFDFIFVDDVDALLKASNNIDKTLKLLGFNEDIINEAYDIIRLIKIGRLNDALKKRKTLKNKISKIKHGCLVIASATGKSYGRKVKLYREILDFEIGFGMNKLRDVIDAYDEEFSKEKILEYIKLLGKGGIVYVSKDYGIEKAQEIEKFLLKKGINAKLIHSKDKKGFDEFKNGNIGVLIGMASYYGILVRGLDMPERVRYALFYGIPKFKIKLKEYIDDLKNKGKLKEDVDIEGKTKEEIKQILIEKLKIKNFSLRKDNNNNEYNLLIPDIKTYIQASGRTSRMTEFGLTKGVSIVLVDEKEIFEYLEKYMLFAYESEFTSIDNIDIKELIKKIDKIREKIKLGRAQGGVPDLLKSILMVVESPNKARTIANFFGKPSIRRMNNRNIYEVCVGDLNLIITASGGHVFDLVTKEGFYGVIINNISIPIYSSIKKVNGKQFIDQKDLEELLSVKKVEETNIMDSKDNIYIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIFLNVLPFNKNIYRVGFNEITKRAILNALESFKKGDKLNLNENKVKGQIVRRVEDRWIGFRLSQKLWEVFNKHYLSAGRIQTPVLGWIIDRYNEHKIKVPYLSLKLENDIFIGKVWEKEFDKKEVKVEVKVYEKEFHPLPPFTTDTLLEEATKRFKISSDEVMNISQELFELGLSTYHRTSSTRVSFDGMRVAREYLKLNNLEDYLKNREYFMEGAHECIRPTKPMDTYELIEYLKENNIKLSKNHIKIYDLIFRRFIASQMKKAVVEYEEIYIKDLDEKIEGYIDIKFEGWSNIYNLRLKKLPKIEKNSLKILDKKVKKIPKVPLYNEGDIVKLMKEKCIGRPSTYATIIKKLLDKGYIIKSRAENKLIPTKLGIEVYDYLITNYFSLISEERTRALEETMDKIENGKVDYLEVLKELHNEILCIN
(1878) DNA topoisomerase 1 [Methanothermococcus okinawensis IH1]
3
MTDLIICEKPNVAKKIASALGNPKKKSNNGIPYYELERNGKKIIVASAVGHLFTLEEEKTGEKKKFGEYPVFNIKWVPASTIKGKEYVQKYINTLKKLAKEADEFYIASDWDIEGELIGYHALYYCCGKNDAKRMRFSSLTKNEIIKAYENPDRVDFGLVDAGDSRHRVDWYYGINVSRALMQSIRAVNRWQTMSTGRVQGPALSFLVDRELEIKKFVPKPYWVIGAHLKNELLAIHEKDKFWDEKEANEIYNRIKDEKEAIISSIKKTKKKIKPNPPFDLGTLQREAHRIFRFSPKKTQEIAQKLYEMGICSYPRTSSQKLPKDDNYIKDILTKVSNHGDYKKYAELILRENRKPIEGKKSDPAHPAIHVVDVPKELLNDDEKKLYDLIVRRTLAAFWDNAEREYINVVLNIDGENFKLSGSRTIKEGWHEIYYFTKFDEKELPSLRKNDKIPVEKITIERKETKPPKRYTMASIIKELESRELGTKATRADIVEKLVKRGYLIDDGSLKVTDLGIAVIETLKKYCPEIIDEKMTRELEKKLDRLQKRTIKKENVLKDAENKLRAILEEVKKKEKEIGKELVEKIDTTNKSLKTVGKCECGGDLIIIKTKGKKRFIGCTNYPECKKTYPLPQKGRIKILNETCEICGAPIISIDNQKVCINPECPSKISNEDKKEMEKAEKSEKICPKCGGKLVVKKGIYGAFLGCENYPKCRYTEKLNNKTKTEKAEKVVVGKCPECGGDLIMRKGRFGEFIGCSNYPKCRYTEKIKNEKTKTKKEKK
(1520) DNA topoisomerase 1 [Methanococcus aeolicus Nankai-3]
3
MTDLIICEKPNVSKKIADALGKPKKKSNDGVPYYEIERNGKKIIVASAVGHLYTLEEKKSDEKGKNKGRNSFGRYPIFDIRWVPASTIKGKEYVQKYINTLNKLSKKSNDYYIASDWDIEGELIGYHALRYCCNEDNAKRMRFSSLTKKDIIKAYEQPDNIDFGLVDAGDTRHRLDWYYGINMSVALMQCIRSVNRWHTMSTGRVQGPALSFLVDRELEIRKFVPVPYWVIDANLKDGLIAIHEKDKFWDEKEANTIYNKIKDEKEAIVANVKKTKKTIKPNPPFDLGALQREAHRIFKFSPKKTQEIAQKLYEKAICSYPRTSSQKLPKDDNYINDILNKVVNHNIYGKYAKSIIEEGRKPIEGKKDDPAHPAIHFVDTPKEELPPEEQKLYDLIVRRTLAVFWDNAEREYSNISLDIGGEIFKLSGSRTIKEGWHEIYYFTKFDETELPALRKNNKIVVEKINIEEKETKPPKRYTMSSIIKELENRELGTKSTRADIVEKLVKRGYLIEDNSLTVTDLGIGVIEVLKKYCPEIIDEQMTRELEKKLDRLQKRTIKKETVLKDAEKKLTAILNEVKKKEKEIGAELVEKVDATNKTLQTIGKCECGGDLGIIRIKNKRRFVGCSNYPECTIAYPLPAKGRIKIPNEVCEVCGKPMLLIDNQKLCVNTDCPSKISEEDKKELEKLEKSEKPCPKCDGTLTVKKGVYGVFLGCSNYPKCKYTEKLHSKKEDSEITVVGECPDCGGDLVIKKGRFGEFIACSNYPKCKHTEKIKKDGKSNAKATKTEKTETKTTKKKSTKGSTTKEKKKPDNSNEVGECPDCGGDLVIKKGRFGEFIACSNYPKCKHTEKIKKD
(1854) DNA topoisomerase 1 [Methanococcus maripaludis X1]
3
MTGLIICEKPNVAKKIAEALGKPKKKSHNSVPYYELERNGESIVVASAVGHLYTLQEKTKTKFGDYPVYDINWVPASTLDEKKYIQKYIDALKKVSKDANKFYVATDWDIEGELIGYHALNFSCGQKNAHRLRFSSLTKKEILKAYENPNEIDFGLVDAGDSRHKIDWYFGINVSRALMQAVSSVKRWKTLSTGRVQGPALAFLVDKELEIRNFVPTPYWVLEALLDNDLIAVHELEKFWDEEQANKAYEKVKGQKQATVSDVKKSMKTIPPNPPFDLGALQREAHNMFRFSPKKTQEVAQKLYEKGYCSYPRTSSQKLPDDKAYMDEVLKNLSKNKNYKPYIETILNENRKPISGKKDDPAHPAVHAVDVPKEKLPDDELKLYELIARRTIALYWDNAKREYSKINLDINGETFKLSGSRTVEEGWHEIYYYTKFDEVELPELKKNDVINVNNINFEAKETKPPKRYTMASIIKELEKRKLGTKATRADILEKLTKRGYVIEDGSLTVTDLGIGVTETLRKYCPEIVEETLTRDLEDKLELIQDKKIKKEEVIQETKDKLTKILGEFRLKEKEIGTELVDKLDSTNRSLQIIGKCKCGGDMIIIRTKGKKRFVGCSNYPDCEVTFPLPQKGRIKVLNEVCEKCQNPVIGLDRIKICVNPDCSTRISEEDKKEIEKAEKEEKICPKCGNKLLIKKGPYGVFRGCENYPKCKYTEKLNGESNEKEIVGKCPKCGSDLYKRKGRFGEFIGCSNYPKCRHTEKIDKKKEDTPGETKAETKKEAKPKTTKKAAPKKTATKTTKTTAKKTATKKTTTKKATAKKTAEK
(1607) Reverse gyrase [Methanocaldococcus fervens AG86]
6
MLVLLMIPMIYKEMCPNCNGEITSKRLEIGVCEKCLKEEKAFEKLKLCEKLREEKTLKNLKNYCNIWNEFKEFEEFVKDLGFELLSIQKMWAKRVLKNKSFSIVAPTGVGKSFFGILMSLFLSKKGKKCYIILPTTLLVKQTYEKMISLIEKNNLNVKVVAYHSELSTKEKKEAKERIDNNDYDILITTSNFLAKNMPNNVFDFIFVDDVDALLKASKNIDRTLKLLGFDDEIINEAYKIIYLIKIGKIESALKKREFLKKKISKINHGCLIIASATGKSYGDRVKLYRELLDFEIGFGMNKLRDVADIYDEEFSKEKILEYVKLFGSGGIVFVSIDYGVEKAQEIEKFLLKNNIKAKLIHSKDKKGFDDFRNGEIDVLIGVASYYGVLVRGLDMPERVRYAIFYGIPKFKIRLKEYINSLKEKGELKEDIDIEGKTEEEIREIIVEKLKIKNFSLRKEDGEYLLLIPDVKTYIQASGRTSRMTEFGLTKGASIVLVDEKEIFEALKKYMLFMYESEFRKIDEINLEELIKKIDEDREKIKLGRAKGKVPDLLKSVLMVVESPNKARTIANFFGKPSVRKINNRNIYEVCIGDLNLIITASGGHVFDLVTKEGFYGIKIDNNLYIPIYASIKKVNGEQFTDQKNFEKLIKQLMERGERVNAMDAKENIEIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIALNALPFNKNIYRVGFNEITKRAILKAVESFKKGEELSLDENKVKGQIVRRIEDRWIGFRLSQKLWEVFNKNYLSAGRVQTPVLGWIIERYNEHKIKVPYLSLRLENDIYVGKIWEEEFNKDEVEVEVNIYDKEISPLPPFTTDTLLEEATKRFGLSADEVMAIAQELFELGLTTYHRTSSTRVSLDGMRVAKEYLKLNNLEDYLKNREYFMEGAHECIRPTKPMDTEELIEFLKESNIKLTKNHIKVYDLIFRRFLASQMKEAVVEYEEIYIKDLDEKIEGYIDVKFDGWSKIYNLKLKKLPKVEKNSLKILEKKITKIPKVPLYDEGEVVKLMKERGIGRPSTYAQIIKKLLDRGYVTKSKNKGKLIPTKLGTEVYNYLINNYPNLISEERTRELEEIMDKIENGEVDYLEVLKALHEEILSIK
(1208) DNA topoisomerase 1 [Methanocaldococcus fervens AG86]
3
MTALIICEKPSVAKKIANALGKAKKKSIDGVPYYELERDGKKIIVASAVGHLFTLVEKENKEFGTYPVFDVKWVPASVDKGKEYVNKYIKALKKLSKEANEFYVATDWDIEGELIGYHALKYCCGREKAKRMRFSSLTKKEIVKAFENPDEIDYGLVDAGESRHIVDWYFGINLSRALMNAIRAVNRWKTMSIGRVQGPALAFLTERELEIKKFVPKPYWVIEALLKDNLKAIHEKEKFWDEKEAKNIYEKIKDEKTAKVLEVKKTKRKIKPLPPFDLGTLQREAYSYFKISPKETQEIAQNLYEKALISYPRTSSQKLPKDRKYLEDILKIIKEHPIYGKWVGRILKDNLKPVGGKKEDPAHPAIHIVDVPKEELSEKEKKIYDLIARRTLAAFWDNAEREYLNIKIDIKGEIFKLSGSRTVKEGWHEIYYFPKFDEVELPPLKKNDIINIEKITITRKETQPPKRYTVASIIKELEKKGLGTKATRAEIVDKLIKRGYVVDEGSLKVTDLGISVIETLKRFCPEIIDEKMTRDLEEKLEKIQFRKIKKDDVLEEAEKKLRKILEEFKKKEKDIGTYLIKNLDSTNKKAKIVGKCPKCGGDLILIRYNKSRFVGCSNYPECDVKYSLPDKGRIKIPNKSCEACKSPILKIGDKEVCINPECPLKYVEVKEENKKCPKCGGDLILKKGIYGAFYGCSNYPKCKYTEPVNKKEKEVVGKCPKCGGDLVIREGKFGKFAGCSNYPKCKYTEKLKIVEKEEK
(1048) DNA topoisomerase 1 [Methanocaldococcus sp. FS406-22]
3
MTALIICEKPSVAKKIANALGKAKKKSIDGVPYYELERNGKKIIVASAVGHLFTLVEKENKEFGSYPVFDIKWVPASVEKGKEYVNKYIKALKKLSKEADEFYIATDWDIEGELIGYHALKYCCGKEKAKRMRFSSLTKKEIVKAFENPDEIDYGLVDAGESRHIVDWYFGINLSRALMNAIRAVNRWKTMSIGRVQGPALAFLTERELEIKKFVPKPYWVIEALFKDNLKAIHEKEKFWDEKEAKSVYEKIKNEKFGKVVEIKKTKRKIKPLPPFDLGTLQREAYSYFKISPKETQEIAQSLYEKGLCLHPDTLILLPDGIKKIKDLDDEGEVLCLNKDLKLTKSKYKLLKRTIKEKLIKITLNDGTELITTKEHPILVYRDELIFIPAEKLKENEQVVMFINNSEKTFKIKKTKFIDFILENKKYSHHYSIICTSDWKNKFKSGIAKKFDLSNQLSKNKGLSLDRLRKLSNYIIDRDLKRIANGDVYIQKIKKIEEIEYEGEVYDLTVKDYHNFIANGIVVHNCSYPRTSSQKLPKDRKYLEDILNIIKNHPVYGKWAERILKENLKPVEGKKEDPAHPAIHIVDIPKEELSEKEKKIYDLIARRTLAAFWDNAEREYLNVKVDIKGEKFKLSGSRTVKEGWHEIYYFPKFDEIELPALKKNDIIKVEKITITRKETQPPKRYTVASIIKELEKKGLGTKATRAEIVDKLIKRGYVIDDGSLKVTDLGISVIETLKKFCPEIIDEKMTRDLEEKLEKIQFRKIKKDDVLEEAEKRLRKILEEFKKKEEDIGIYLIKNLDATNKKAKIVGKCPKCGGDLILIRHKKGRFVGCSNYPECDVKYSLPDKGRIKIPNKVCEACKSPILKIGDREVCINPECPLKQVEVKEDDRICPKCGAKLVLKKGIYGAFYGCSNYPKCKYTEPINKKEVVGKCPKCGGDLVVRDGKFGKFVGCSNYPKCKYTEKLKSNEKEK
(561) Reverse gyrase [Methanocaldococcus sp. FS406-22]
6
MIPMIYKEMCPNCNGEITSERLAIGVCEKCLKEKNVFEKLKLCEKLREEKTLKELKSYCIIWNEFKEFEEFAKSLGYELLSIQKMWAKRVLKNKSFSIVAPTGVGKSFFGILMSLFLAKKGKRCYIILPTTLLVKQTYEKMLSLVEKNNLNIKVVAYHSELSTKEKKEAKERIENNDYDVLITTSNFLTKNMPNCRFDFVFVDDVDALLKASKNIDRTLKLLGFDEEIINEAYKIIYLIKIGKIEDAMKKREILKEKVAKIKHGCLIIASATGKSYGDRVKLYRELLDFEIGFGMNKLRDVVDIYDEEFSKEKILEYIKLFGSGGIVFVSIDYGVEKAQEIEKYLLDNNIKAKLIHSKDKKGFDDFREGKIDVLIGVASYYGVLVRGLDMPERVRYAIFYGIPKFKIRLKEYINSLKEKGELKEDIDIEGKTEEEIRQIITEKLKIKNFSLRKEDDEYLLLIPDVKTYIQASGRTSRMTEFGLTKGASIVLVDEKEIFEALKKYMLFMYESEFKRIDEINLEELIKKIDEDREKIKVGRAKGKVPDLLKSVLMVVESPNKARTIANFFGKPSVRKINNRNVYEVCIGDLNLIITASGGHVFDLVTKEGFYGVKIEDNLYIPIYTSIKKVNGEQFTDQKDLEELIRQLMEKGEKVNAMDAKENVEIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIAINALPFNKNIYRVGFNEITKRAILKAVESFKKGDKLELDENKVRGQIVRRIEDRWIGFRLSQKLWEVFDKNYLSAGRVQTPVLGWIIERYNEHKIKVPYLSLKLENDIYIGKIWEDEFDKDEVEVEVKVYEKEIPPLPPFTTDTLLEEATKRFGLSTDEVMSIAQELFELGLTSYHRTSSTRVSLDGMRVAREYLKLNNMEDYLKNREYFMEGAHECIRPTKPMDTEELIEFLKENNIKLTKNHIKVYDLIFRRFIASQMKEAVVEYEEIYIKDLDEKVEGYIDIKFDGWSRIYNLKLKKLPRIEKSTLKVLDKKLRKIPKVPLYDEGEVVKLMKERGIGRPSTYAQIIKKLLDRGYVIKSRDKNKLIPTKLGIDVYNYLISNYPHLISEERTRELEEIMDKIENGEVDYLEVLKALHEEILSIK
(296) DNA topoisomerase 1 [Methanococcus voltae A3]
3
MTGLIICEKPNVAKKIADALGKPKKKSQSKVPYYEVDTKGKTYYVASAVGHLYTLIEKNKTKFGDYPTYDIDWAPASTVEGKEYVQKYINVLKKLSKDANEYYVATDWDIEGELIGYHALHHACGQDIAKRMRFSSLTKKEILKSFENTDSIDFGLVDAGDSRHKIDWFFGINISRALMQAISSAKRWKTMSTGRVQGPALAFLVEKELEIQKFVPVPYWVINANLKNENENNEVPLIATHEIDKFWDEEEANKAYGNVEGQKEAIVEEIKKTKKKIKPYPPFDLGALQREAHNAFRYSPKRTQEIAQKLYEKGYCSYPRTSSQKLPKDMEYMNEVLGKLLKSKEYGKYASEILEKNLKPIEGKKDDPAHPAIHPVDVPKEALPDDEQKLYNLIARRALAAYWDDAEREYSKITVDINGEKFKLSGSRTTHEGWHEIYYFTKFDENELPELKKGKVLPIESTEKLAKETKPPKRYTMASIIKELENRHLGTKATRADILEKLTKRGYVIEDGSLSVTELGIGVIETLKKYCPEIVEETLTRDLEDKLEKIQDHKIKKEQVIDETKVKLSQILDEFRKKEKEIGKELVEKIDSTNRSLQLIGKCKCGGDLIIIKYKGKSRFVGCSNYPDCDITYPLPQKGAIKVPNKVCEVCGLPIINYMGKDLCVNIECSSRISEEDKKILEKIENEKEEEKICPKCGGTLTIKRGAFGVFRGCSNYPECKYTENLKGESNEKEIVGKCPKCGSDLVKRKGRFGEFIGCSNYPKCRHTEKILKEGEEGKEPKKATKKTTTKKTATKKTTTKKTATKKTTTKKTATKKTTKKTPAKKKE
Family distribution
Taxonomy tree
Methanococci