Toggle navigation
TopoIBase
Data
Taxonomy and VLD families
Downloads
My selection
Upload to selection
Selection 1
Selection 2
Selection 3
Tools
Blast
MUSCLE
VLD
About
How to use
Acknowledgements and references
Contact
Tests
Search more
Download
fasta
tsv
Download
Blast
Muscle
VLD
Add to selection
Selection 1
Selection 2
Selection 3
All selections
Taxon : Methanococcaceae
Informations
Name
Methanococcaceae
Rank
family
# topoisomerases
6
Lineage and sub-taxa
Lineage
Archaea
>
Euryarchaeota
>
Methanococci
>
Methanococcales
>
Methanococcaceae
Sub-taxa
Topoisomerases
Select all
Name
Family
Sequence
(1236) DNA topoisomerase 1 [Methanococcus vannielii SB]
3
MTGLIICEKPNVAKKIAEALGKPKKKSHNSVPYYELERNGEDIIVASAVGHLYTLQEKEKTKFGDYPVYDIEWVPASTLDDKKYIQKYIDTLKKVSKEASKFYVATDFDIEGELIGYHALSHACGQKNAHRLRFSSLTKKEIIKSFENPNQIDFGLVDAGDSRHKIDWYFGINVSRALMQAVSSAKRWKTLSTGRVQGPALAFLVDKEIEIKNFIPTPYWVLEAVLDNNLKALHELEKFTDEKRAKEAYEKVKNEKEALVTEIKKTLKSIPPNVPFDLGALQREAHNVFRFSPKKTQEVAQKLYEKGYCSYPRTSSQKLPDDKAYMDEVLKNLSKNKEYSKYIELILSEGRKPVDGKKDDPAHPAIHAVDVPKENLPDDELKLYELIARRTIALYLDDAKREYSKISLEINGEPFKLNGSRTIEEGWHELYYFTKFDEIELPTLKKKDLLRINEIAFEEKETKPPKRYTMASIIKELEKRTLGTKATRADILEKLTKRGYVIDDGSLTVTELGIGVTETLRKFCPEIVEETLTRDLENKLELIQDKKIKKETVIKETKDKLTKILGEFKLKEKEVGNELVEKLDSTNRSMQVIGKCKCGGDMIIIRTKGKKRFVGCSNYPECEITFPIPQKGRIKVINEVCKTCENPIIGLDSIKICVNPDCKTRISEEDRKEMEKAALEEKSCPKCGGKLSIKKGPYGVFRGCENYPKCKYTEKLNGESNEKEVIGKCPKCGNDLLKRKGRFGDFIGCSNYPKCRYTEKIEKKKEGDLEDKIEVTKEKVKAKETLKSEKNLDKTLDNPKPKRTKTASKKKKEELKN
(1047) Reverse gyrase [Methanothermococcus okinawensis IH1]
6
MIPIIYKEMCPNCNGEITSERLEIGVCERCLKEEKVFEKLELCKKLREEHTLNNLKNYCNTWKEFKEFNKFTKSLGYELLSLQKMWAKRILKNKSFSIVAPTGVGKSFFGILISLFLAKKGKKCYIILPTTILVRQNYEKILSLIENKLNINIIAYHSELSAKEKKKAKENIKNNNYDLLITTSNFLVKNIPNTAFDFIFVDDVDALLKASNNIDKTLKLLGFNEDIINEAYDIIRLIKIGRLNDALKKRKTLKNKISKIKHGCLVIASATGKSYGRKVKLYREILDFEIGFGMNKLRDVIDAYDEEFSKEKILEYIKLLGKGGIVYVSKDYGIEKAQEIEKFLLKKGINAKLIHSKDKKGFDEFKNGNIGVLIGMASYYGILVRGLDMPERVRYALFYGIPKFKIKLKEYIDDLKNKGKLKEDVDIEGKTKEEIKQILIEKLKIKNFSLRKDNNNNEYNLLIPDIKTYIQASGRTSRMTEFGLTKGVSIVLVDEKEIFEYLEKYMLFAYESEFTSIDNIDIKELIKKIDKIREKIKLGRAQGGVPDLLKSILMVVESPNKARTIANFFGKPSIRRMNNRNIYEVCVGDLNLIITASGGHVFDLVTKEGFYGVIINNISIPIYSSIKKVNGKQFIDQKDLEELLSVKKVEETNIMDSKDNIYIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIFLNVLPFNKNIYRVGFNEITKRAILNALESFKKGDKLNLNENKVKGQIVRRVEDRWIGFRLSQKLWEVFNKHYLSAGRIQTPVLGWIIDRYNEHKIKVPYLSLKLENDIFIGKVWEKEFDKKEVKVEVKVYEKEFHPLPPFTTDTLLEEATKRFKISSDEVMNISQELFELGLSTYHRTSSTRVSFDGMRVAREYLKLNNLEDYLKNREYFMEGAHECIRPTKPMDTYELIEYLKENNIKLSKNHIKIYDLIFRRFIASQMKKAVVEYEEIYIKDLDEKIEGYIDIKFEGWSNIYNLRLKKLPKIEKNSLKILDKKVKKIPKVPLYNEGDIVKLMKEKCIGRPSTYATIIKKLLDKGYIIKSRAENKLIPTKLGIEVYDYLITNYFSLISEERTRALEETMDKIENGKVDYLEVLKELHNEILCIN
(1878) DNA topoisomerase 1 [Methanothermococcus okinawensis IH1]
3
MTDLIICEKPNVAKKIASALGNPKKKSNNGIPYYELERNGKKIIVASAVGHLFTLEEEKTGEKKKFGEYPVFNIKWVPASTIKGKEYVQKYINTLKKLAKEADEFYIASDWDIEGELIGYHALYYCCGKNDAKRMRFSSLTKNEIIKAYENPDRVDFGLVDAGDSRHRVDWYYGINVSRALMQSIRAVNRWQTMSTGRVQGPALSFLVDRELEIKKFVPKPYWVIGAHLKNELLAIHEKDKFWDEKEANEIYNRIKDEKEAIISSIKKTKKKIKPNPPFDLGTLQREAHRIFRFSPKKTQEIAQKLYEMGICSYPRTSSQKLPKDDNYIKDILTKVSNHGDYKKYAELILRENRKPIEGKKSDPAHPAIHVVDVPKELLNDDEKKLYDLIVRRTLAAFWDNAEREYINVVLNIDGENFKLSGSRTIKEGWHEIYYFTKFDEKELPSLRKNDKIPVEKITIERKETKPPKRYTMASIIKELESRELGTKATRADIVEKLVKRGYLIDDGSLKVTDLGIAVIETLKKYCPEIIDEKMTRELEKKLDRLQKRTIKKENVLKDAENKLRAILEEVKKKEKEIGKELVEKIDTTNKSLKTVGKCECGGDLIIIKTKGKKRFIGCTNYPECKKTYPLPQKGRIKILNETCEICGAPIISIDNQKVCINPECPSKISNEDKKEMEKAEKSEKICPKCGGKLVVKKGIYGAFLGCENYPKCRYTEKLNNKTKTEKAEKVVVGKCPECGGDLIMRKGRFGEFIGCSNYPKCRYTEKIKNEKTKTKKEKK
(1520) DNA topoisomerase 1 [Methanococcus aeolicus Nankai-3]
3
MTDLIICEKPNVSKKIADALGKPKKKSNDGVPYYEIERNGKKIIVASAVGHLYTLEEKKSDEKGKNKGRNSFGRYPIFDIRWVPASTIKGKEYVQKYINTLNKLSKKSNDYYIASDWDIEGELIGYHALRYCCNEDNAKRMRFSSLTKKDIIKAYEQPDNIDFGLVDAGDTRHRLDWYYGINMSVALMQCIRSVNRWHTMSTGRVQGPALSFLVDRELEIRKFVPVPYWVIDANLKDGLIAIHEKDKFWDEKEANTIYNKIKDEKEAIVANVKKTKKTIKPNPPFDLGALQREAHRIFKFSPKKTQEIAQKLYEKAICSYPRTSSQKLPKDDNYINDILNKVVNHNIYGKYAKSIIEEGRKPIEGKKDDPAHPAIHFVDTPKEELPPEEQKLYDLIVRRTLAVFWDNAEREYSNISLDIGGEIFKLSGSRTIKEGWHEIYYFTKFDETELPALRKNNKIVVEKINIEEKETKPPKRYTMSSIIKELENRELGTKSTRADIVEKLVKRGYLIEDNSLTVTDLGIGVIEVLKKYCPEIIDEQMTRELEKKLDRLQKRTIKKETVLKDAEKKLTAILNEVKKKEKEIGAELVEKVDATNKTLQTIGKCECGGDLGIIRIKNKRRFVGCSNYPECTIAYPLPAKGRIKIPNEVCEVCGKPMLLIDNQKLCVNTDCPSKISEEDKKELEKLEKSEKPCPKCDGTLTVKKGVYGVFLGCSNYPKCKYTEKLHSKKEDSEITVVGECPDCGGDLVIKKGRFGEFIACSNYPKCKHTEKIKKDGKSNAKATKTEKTETKTTKKKSTKGSTTKEKKKPDNSNEVGECPDCGGDLVIKKGRFGEFIACSNYPKCKHTEKIKKD
(1854) DNA topoisomerase 1 [Methanococcus maripaludis X1]
3
MTGLIICEKPNVAKKIAEALGKPKKKSHNSVPYYELERNGESIVVASAVGHLYTLQEKTKTKFGDYPVYDINWVPASTLDEKKYIQKYIDALKKVSKDANKFYVATDWDIEGELIGYHALNFSCGQKNAHRLRFSSLTKKEILKAYENPNEIDFGLVDAGDSRHKIDWYFGINVSRALMQAVSSVKRWKTLSTGRVQGPALAFLVDKELEIRNFVPTPYWVLEALLDNDLIAVHELEKFWDEEQANKAYEKVKGQKQATVSDVKKSMKTIPPNPPFDLGALQREAHNMFRFSPKKTQEVAQKLYEKGYCSYPRTSSQKLPDDKAYMDEVLKNLSKNKNYKPYIETILNENRKPISGKKDDPAHPAVHAVDVPKEKLPDDELKLYELIARRTIALYWDNAKREYSKINLDINGETFKLSGSRTVEEGWHEIYYYTKFDEVELPELKKNDVINVNNINFEAKETKPPKRYTMASIIKELEKRKLGTKATRADILEKLTKRGYVIEDGSLTVTDLGIGVTETLRKYCPEIVEETLTRDLEDKLELIQDKKIKKEEVIQETKDKLTKILGEFRLKEKEIGTELVDKLDSTNRSLQIIGKCKCGGDMIIIRTKGKKRFVGCSNYPDCEVTFPLPQKGRIKVLNEVCEKCQNPVIGLDRIKICVNPDCSTRISEEDKKEIEKAEKEEKICPKCGNKLLIKKGPYGVFRGCENYPKCKYTEKLNGESNEKEIVGKCPKCGSDLYKRKGRFGEFIGCSNYPKCRHTEKIDKKKEDTPGETKAETKKEAKPKTTKKAAPKKTATKTTKTTAKKTATKKTTTKKATAKKTAEK
(296) DNA topoisomerase 1 [Methanococcus voltae A3]
3
MTGLIICEKPNVAKKIADALGKPKKKSQSKVPYYEVDTKGKTYYVASAVGHLYTLIEKNKTKFGDYPTYDIDWAPASTVEGKEYVQKYINVLKKLSKDANEYYVATDWDIEGELIGYHALHHACGQDIAKRMRFSSLTKKEILKSFENTDSIDFGLVDAGDSRHKIDWFFGINISRALMQAISSAKRWKTMSTGRVQGPALAFLVEKELEIQKFVPVPYWVINANLKNENENNEVPLIATHEIDKFWDEEEANKAYGNVEGQKEAIVEEIKKTKKKIKPYPPFDLGALQREAHNAFRYSPKRTQEIAQKLYEKGYCSYPRTSSQKLPKDMEYMNEVLGKLLKSKEYGKYASEILEKNLKPIEGKKDDPAHPAIHPVDVPKEALPDDEQKLYNLIARRALAAYWDDAEREYSKITVDINGEKFKLSGSRTTHEGWHEIYYFTKFDENELPELKKGKVLPIESTEKLAKETKPPKRYTMASIIKELENRHLGTKATRADILEKLTKRGYVIEDGSLSVTELGIGVIETLKKYCPEIVEETLTRDLEDKLEKIQDHKIKKEQVIDETKVKLSQILDEFRKKEKEIGKELVEKIDSTNRSLQLIGKCKCGGDLIIIKYKGKSRFVGCSNYPDCDITYPLPQKGAIKVPNKVCEVCGLPIINYMGKDLCVNIECSSRISEEDKKILEKIENEKEEEKICPKCGGTLTIKRGAFGVFRGCSNYPECKYTENLKGESNEKEIVGKCPKCGSDLVKRKGRFGEFIGCSNYPKCRHTEKILKEGEEGKEPKKATKKTTTKKTATKKTTTKKTATKKTTTKKTATKKTTKKTPAKKKE
Family distribution
Taxonomy tree
Methanococcaceae