Selection 1

Selection 2

Selection 3

All selections

Taxon : Methanosarcina

Informations

Name	Methanosarcina
Rank	genus
# topoisomerases	6

Lineage and sub-taxa

Lineage	Archaea > Euryarchaeota > Methanomicrobia > Methanosarcinales > Methanosarcinaceae > Methanosarcina
Sub-taxa

Topoisomerases

Select all	Name	Family	Sequence
	(879) DNA topoisomerase 1 [Methanosarcina barkeri str. Fusaro]	3	MHLIVTEKNIAARRIAAILAPKNPKKDRVSGVDVYRYEIVSDEEKQETVVVGLSGHIVGIDFPKEYNNWQKVESKTLINADIITTPINRKIVTALKGLGKKASRVTIATDYDREGELIGVEALNIIKQVNPDVPFDRVRYSAITPKAIEAAFSNATDVDFNLADAGHSRQVIDLVWGAALTRYISLAAGRLGKMFLSVGRVQSPTLSLIVDREKERNVFVPTPYWEIYAELQNTEGKTFSAQHSTRRFLDKKEATKAFKKLGKKAELKGIEKGKKTDQPPAPFNTTGFISAANSIGLSPANAMRIAEALYTNGYISYPRTDNTVYPETLDLRAQIEIFKEGPFKEYADALLEKAELIPTRGKKETTDHPPIFPASLAKESDLKEDEWKVYELVVRRFFATFAGPSEWETMRLKLDINGEEFKANGARLVEQGWRWYYPYNAPEDRLFPELHEGDSLKVIKKDMQDKETQPPGRYGQGRLINIMEELGLGTKATRHEIISKLYSRAYIHGNPVQPTNTSFAVMDTLEKYSPTITKPDMTKLLEENMDRIAEGKIKEAAVLEESRDMLKQVFSELDKNREKIVESLQAGLREDKIIGTCSSCGNELIIRRSKRGGRFIGCNNYPNCTFSLPLPRSGQIIVTDKVCEVHGLHHIRIINSGKRPWDLGCPQCNFIEWQKTQQEEQAQQPKKEKPKSIKDLEGVGKATAGKLEEAGITSVEALAEADPVELAKAIKTSVKRVKSWQVSCNGIVTVEGNSTAEGNSTVKGNCTVEDA
	(101) DNA topoisomerase [Methanosarcina barkeri str. Fusaro]	3	MTIVAFAEKNKAASQIASILGEGEVERITVEGLPVYEFKWKGEEWLVMGLSGHIMNYDFPEQYNKWKEVNPGVLLEIDPQKLVTRTDYAAAVKNLAKRANKIVLACDYDREGENIGFEAKTLAEKVTNVPIERARFSSLSPKEVKKAFESLINPDYNMAMAAEARQILDLKMGAAFTRFVTLSVRERARTKDILSIGPCQTPTCGFVYEREKAIRAFQAKDFWKITAIFSAESGKEGGKEGRKEGRKEGKKERGDFEGTHRAGNIHDKEKAAEIFKRLKGTKEGLVAKKTVKETKTSPPNPLNTTEFLKRASKFLGISPELALEVAEQLYLAGFTSYPRTETNKYAEDFDFKSLVFDFARQKEYKPFAESILIAPIVPKNGEKDAHDHPPIHPIRAASRGEVSSAVNIPQAPEVYNLIARHFLANLMPAAVFEKTHLHLLVNEEPFDSSGTVLKDSGWLEAYPFENKKDKLLPFVEEGQKVGVKKLSNTKSKTSPPKKLTEAELLTLMDKNGIGTKATAPTHIETNKKRGYLETKGKTISILDTGFTLMDGLSLTVPILVKPEIRAKIEALIQEVEDGKKEFEAALYEGTTLIKEMYAQLEANKKELTSSIAGTIKDEAALEDKKNYIGTCKACGHVLRIVQTDSGRFVGCTGYPDCRNSYPLPKAGALTVLRSKECKKGGVAVLKVGNKYNWAVGIGPCFTCDLEKECYPPETVGPCPECDGSMFLINFKDTRFLGCTKRCGYTHSVPKTGKLTILDKTCETCGWKLFRLKDGDRPEEEFCINRRCTEGRKYWKKPGKGAETRIKEKASVSRPAASSVAKQAASSATSSAASPEVTQAKRKTSKVSAAGLKKSK
	(1532) DNA topoisomerase 1 [Methanosarcina acetivorans C2A]	3	MHLIVTEKNIAARRIAAILAPKSPKKERVSGVDVYRYELGKGKSRQETAVVGLSGHIVGIDFQKEYNNWQKVDARALIDAEITTTPINRKIVTALRTLGKEADRVTIATDYDREGELIGVEALNIIKKVNPEVPFDRVRYSAITPKAIDAAFTNPTSVDFDLADAGHSRQVIDLVWGAALTRYISLAAGRLGKMFLSVGRVQSPTLSLVVDREKERNIFVPTPYWEIHVELETKAGETFSAQHSTRRFLDKEEATAVFKKLGKKAELKEIEKGTKSDLPPTPFNTTGFISAANSIGLSPANAMRIAESLYTNGYISYPRTDNTVYPETLDLRAQIEIFTEGPFKEFADALLEKAELVPTRGKKETTDHPPIYPASLAKESELKEEEWKVYELVVRRFFATFAGPSTWETMRLRLEINAEEFRANGARLLEPGWRWYYPYNVPEDRLFPELSEGEILKVIKKEMLDKETQPPGRYGQGRLINIMEELGLGTKATRHEIISKLYSRAYIHGNPVQPTNTSFAVVETLEKYSPTITKPDMTKLLEENMDLIAEGKIKEDTVLEESREMLQQVFSELDKNRDKIIESLQAGLREDKIIGNCSLCGNELMIRRSKRGSRFIGCSNYPNCTFSLPLPKSGQIVVTDKQCETHGLHHIRIINAGKRPWDLGCPQCNFIEWQKTQKEKQAQQPKKEKPKTIKDIEGVGKATAGKLEEAGITSVEALAEADPIELAKTIKTSVKKVKTWQISCNGGIVEDL
	(720) DNA topoisomerase [Methanosarcina acetivorans C2A]	3	MTVVAFAEKNKAAAQIASILGDGEVDKISVEGLPAYEFKWKGEEWLVMGLSGHIMNYDFPEQYNKWSEVNPGTLLGVDPEKFVTRAEYATAIKKLAKRADKIILACDYDREGENIGFEAKTLAEEVTDVPVARARFSALSPKEVRKAFESPVDPDHNLAMAAETRQILDLKMGAAFTRFVTLSVREKARTKDILSIGPCQTPTCGFVYEREKAIRAFKAKDFWKITAIFGAKGGDFEGTHRAGNIHDKEKAAEIFKRLKGAKEGFVVKKTVKEAKTSPPNPLNTTEFLKRASKFLGISPEVALEVAEQLYLAGFTSYPRTETNKYADDFDFKTLLFDFARQKEYKPFAESILSAPIVPKNGDKDAHDHPPIHPIRVAAKGEISAAVTIPHAAEVYDLIARHFLANLMPAAVFEKTHLHLQVREEPFDSSGTVLKDAGWLEVYPFENKKDKLLPFVEEKEKVDVKKLSNTKSKTSPPKKLTEAELLTLMDKHGIGTKATAPTHIETNKKRGYFETKGKTVSILDTGFTLMDGLSLTVPILVRPDIRAKIEALIQEVEDGKKEFEAALAEGTALIKEMYAQLEANKKELTSNIAGTIKDEAALEDKKNYIGTCKACGHVLRIVQTDTGRFVGCTGYPDCRNSFPLPKTGALTVLRSKECKKGGAAVLKVGNKYNWAVGIGPCFKCELEKECYPPETVGPCPECDGSMFLISFKDSRFLGCTKRCGYTHSVPKTGKLTLLDKTCETCGWKLFRLKEEEKPELDFCVNRRCPEGRKYWKQAGSRTEPRDQAKVAAASSVPAPKVRAGRTPEAKSTPETRSMPRKAESPASGRVSKLSSTASRRKESK
	(891) DNA topoisomerase [Methanosarcina mazei Go1]	3	MTVVAFAEKNKAAAQIASILGEGEVDKISVEGLPAYEFKWKGEEWLVMGLSGHIMNYDFPEKYNKWSEVDPGTLLGVDPEKFVTRKEYEAAIKNLAKRADKIILACDYDREGENIGFEAKTLAEEVTDVPVARARFSALSPKEVRKAFENPVDPDHNLAMAAEARQILDLKMGAAFTRFVTLSVREKARTKDVLSIGPCQTPTCGFVYEREKAIRAFEAKDFWKITAVFAAKGGEFEGTHRAGNIHDKEKAAEIFKRLKGAKEGLVVKKTVKEAKTSPPNPLNTTEFLKRASKFLGISPEVALETAEQLYLAGFTSYPRTETNKYADDFDFKSLVFDFARQKEYKPFAESILSAPIVPKNGEKDAHDHPPIHPIRAAARGEVSSAVNIPQAAEVYDLIARHFLANLMPAAVFEKTHLHLQVKEEPFDSSGTVLKEPGWLEVYPFENKKDKLLPFVEEKERVDVKKLSNTKSKTSPPKKLTEAELLTLMDRHGIGTKATAPTHIETNKKRGYFENKGKTISILDTGFTLMEGLSLSVPILVKPDIRSKIEALIQEVEDGKKEFEAALADGTVLIKEMYAQLEANKKELTSNIAGTIKDEAALEDKKNYIGTCKACGHVLRIIQTDSGRFVGCTGYPDCRNSFSLPKTGALTVLRSKECKKEGAAVLKVGNKYNWAVGIGPCFKCEFEKECYPPETVGPCPECDGSMFLISFKDNRFLGCTKRCGYTHSVPKTGKLTLLDKTCETCGWKLFRLKEEVEGNESLEEDICINRRCTEGIKYWKKVGPRSGARAQGKISADSGAELGARSTARNKERTTARRVSKTVSVADSRKDRK
	(1737) DNA topoisomerase 1 [Methanosarcina mazei Go1]	3	MHLIVTEKNIAARRIAAILAPKSPKKERVSGVDVYRYEIGSGENRQETAVVGLSGHIVGIDFPKEYNNWQKVDARDLIDAEITTTPINRKIVTALKSLGKEADRVTIATDYDREGELIGVEALNIIKKVNPKIPFDRVRYSAITPKAIEAAFSNPTNVDFNLADAGHSRQVIDLVWGAALTRYISLAAGRLGKMFLSVGRVQSPTLSLIVDREKERNIFVPTPYWEIHVELEDAAGETFSAQHSTRRFLDKEEASKVFRKLGKKAELKEIEKGTKTDQPPTPFNTTGFISAANSIGLSPANAMRIAESLYTNGYISYPRTDNTVYPDTLDLKAQIEIFKEGPFKEYANTLLEKPELVPTRGKKETTDHPPIFPASLAKESDLKEDEWKVYELVVRRFFATFAGPSIWETMRLKLDIEGEEFRANGARLLEPGWRWYYPYNAPEDRLLPELKESDLLKVIKKEMLDKETQPPGRYGQGRLINIMEELGLGTKATRHEIISKLYSRAYIHGNPVQPTNTSFAVMDTLEKYSPTITKPDMTKLLEENMDKIAEGKIKEEAVLEESREMLKQVFSELDKNRDNIIESLQAGLREDKIIGDCSLCGNELMIRRSKRGSRFIGCSNYPNCTFSLPLPKSGQIIVTDKLCEAHGLHHIRIINQGKRAWDLGCPQCNFIEWQKTQKEEQAQQPKKEKPKSIKDLEGVGKATAGKLEEAGITSVEALAEADPVELAKTIKTSVKKIKNWQTSCNGGAVEDL

Family distribution

Taxonomy tree

Methanosarcina