Toggle navigation
TopoIBase
Data
Taxonomy and VLD families
Downloads
My selection
Upload to selection
Selection 1
Selection 2
Selection 3
Tools
Blast
MUSCLE
VLD
About
How to use
Acknowledgements and references
Contact
Tests
Search more
Download
fasta
tsv
Download
Blast
Muscle
VLD
Add to selection
Selection 1
Selection 2
Selection 3
All selections
Taxon : Micrococcaceae
Informations
Name
Micrococcaceae
Rank
family
# topoisomerases
10
Lineage and sub-taxa
Lineage
Bacteria
>
Actinobacteria
>
Actinobacteria
>
Actinobacteridae
>
Actinomycetales
>
Micrococcineae
>
Micrococcaceae
Sub-taxa
Topoisomerases
Select all
Name
Family
Sequence
(1365) DNA topoisomerase 1 [Micrococcus luteus NCTC 2665]
8
MSTPPASVTASVPEGKKLVIVESPAKSKSIAKYLNAVGSGWVVDSSVGHIRDLPKPSDLPADMKKGPFGKFAVDTEHGFTPYYVVHPDKKKKVTELKRELKDAEALYLATDADREGEAIAWHLLDTLKPTVPVYRMTFGEITQEGVRRGLENIRELDTALVDAQETRRILDRLFGYELSPVLWRKVSRGLSAGRVQSVATRLVVERERERMAFVSAHYWGVEGTFTVAEGAQAADAVGSSFTARLSTVDGERVATGRDFDDAGRLKASAGKKVTHLDEAGARSLAEGLRGADFTVDSVEDKPYTRRPAAPFTTSTLQQEAARKLRMSSRVSMQVAQRLYENGYITYMRTDSVNLSQEAVQAARRQATELYGADAVPAQPRVYAKRNETAQEAHEAIRPAGDSFRTPAQVKAELRPDEFRLYELIWKRTVASQMADAKGYTATLRLSAAAQDGRLAQFSASGTVITFKGFLDAYEEGRDAEVDGENAEAKDRRLPQVAQGERLTGDPIEATGHETSPPARYTEASIVAELERREIGRPSTYAPTISTIMDRGYVSKRGTALVPSWTAFAVIGLLEDYFATYVDYDFTARMEDDLDRIAAGELGREAWLQTFYFGAPAAETEKGVEGLKHVVDNLGEIDARAVNSLPITEDITLRVGQYGPYLERSLPADAEAGATPPRANVPEDLAPDELTPAKAEELFATARPSERELGTDPETGRTVVAKDGRYGPYVTEVIPEMTEEELQAWLDAQPTEYYKNGKPKPKKKPAKEKPRTGSLFTSMSVDTVTLEQALQLMSLPRVVGADAEGEVITAQNGRFGPYLKKGSDSRSLESEDQIFSITQEQALEIYAQPKQRGRGAAKPPLAEFGEDPVSGKKVTVKEGRFGPYVTDGVTNITVPRDRQPEELTAEEAYQLLADKRAKGPATRGGAKKPAARKAPAKKTTARKKA
(563) DNA topoisomerase 1 [Arthrobacter arilaitensis Re117]
8
MPPKAKEKTGKKLVIVESPAKVKSIAKYLGEGFDVDASVGHIRDLPQPSELPTELKKTSVGKFAVDLDNDFEPYYMVYPDKKKRVSELKAKLKEADELYLATDADREGEAIAWHLLQVLKPKVPVRRLAFTEITKEGIARALENMRELDTDLVDAQETRRVLDRLYGYEISPVLWRKVARGLSAGRVQSVATRLVVERERERMAFIPAGYWDVKGNFATSEGEGFAAKLSAVDGARVASGRDFDDRGQLKTTRSKLAHLDQDSAQSLVANLSDTDFAVTSVEDKPYTRRPAAPFTTSTLQQEASRKLRWSSKITMQIAQRLYENGYITYMRTDSVFLSGEAVNAARKQATELYGADSVPAKPRVYKAKNDAAQEAHEAIRPAGDMFRRPKDVRSSLSKDEYALYELIWKRTVASQMADAKGFTATIKLQGTASDNRVAEFSASGTVITFRGFLSAYEEGKDEQALEAAAENAEARLPQLRVGQHLAGDELIALGHETTPPARYTEASIVAELEKREIGRPSTYAPTISTIMDRGYVTKRGGALVPSWIAFSVIRLLEEHFAKYVDYDFTARLEDDLDEIAKGQRARTDWLNLFYFGKGAEAQGEGLKHVVDNLGDIDARAINSIKITDDITLRVGKFGPYLERAIPEGAEEGTDPQRANVPEDLAPDELTAEKAEELFANSQVSEMDLGTDPETGRKIVAKDGRYGAYVTEIIPEPTAEELAAQPVEYYKNGKPKPPKKPTKVKPRTASLFKSMTVESVTLEEALKLMSLPRVLGADAEGEEITVQNGRFGPYLKKGSDSRSIESEEQIFTITLDEALAIYAQPKQRGRRAAVPPLAEFGVDPTSEKNIVVKDGRFGPYITDGITNITVPRTTSLEELTREQAIELLADKRARGPVKRTAKKAPAKKPAAKKAPAKKTTAKKTTAKKTD
(177) DNA topoisomerase 1 [Arthrobacter chlorophenolicus A6]
8
MPSKAKTGKKLVIVESPAKSKTIAKYLGEGFIVEASIGHIRDLPQPSELPAELKKTSVGKFAVDIDHDFKPYYVVSPDKKKKVTELKAALKDADELYLATDGDREGEAIAWHLLEVLKPKVPVYRMTFGEITKEAIQRAMGNLRDVDQDLVDAQETRRILDRLYGYEISPVLWRKVARGLSAGRVQSVVTRMVVDRERERMAFKAASYWDLTGQFGADSGSFKAKLASVDGAKVATGRDFNDDGVLTSKNVAHLNEELAGSLAAGLQDAPFTVRSVETKPYTRRPAAPFTTSTLQQEAGRKLRFSSKSTMQIAQRLYENGYITYMRTDSSALSDEAVTAARRQASELYGPEYIPGSPRVYSNKAANAQEAHEAVRPAGDSFRTPAQVASQLRGDEFRLYELIWKRTVASQMADAKGSTATIRLGAVAVSGDAAGRDAEFSASGTVITFPGFLAAYEEGKDESRGDDDSDEARRLPNVAKGDSLKASDIVAVGHETSPPPRYTEASLTAELEKKGIGRPSTYASTISTIQDRGYVRKQGSALVPSWIAFSVIRLLEQHFSDYVDYEFTADMEGDLDKIANGQAAGTSWLRHFYFGEDSDPGLLSIVNNLGEIDAREINSIPITDQITLRVGKFGPYLESSAATVDPKTGEIVESPRANVPEDLAPDELTAAKAVELMETAAPEERVLGADPHTGHTVVAKNGRYGAYVTEVIPEMTEEQIAAQPVEYYKNGKPKPPKKPVKAKPRTGSLFKSMTVESVTLDEALQLMSLPRALGEDSEGNLITVQNGRFGPYLKKGTDSRSIGTEEEIFTITLEQALEIYSQPKQRGARAAVPPLAEFGPDPVSEKNIVVKEGRFGPYITDGITNITVPRATSLEELTREQAVELLAEKRAKGPVKRTATRKAPAKKKATAKK
(1843) DNA topoisomerase 1 [Kocuria rhizophila DC2201]
8
MASKATKNEGTGKSLLIVESPSKVKTIAGYLGDAYEVESSMGHIRDLPQPSELPTDMKKGPYGKFAVDVEHEFDPYYVVNPDKKKKVTELKRKLKDADALYLATDGDREGEAIAWHLLQVLKPKVPVYRLTFPEITKEAIERGFGQLRDIDQDLVDAQETRRILDRLYGYEISPVLWRKVAAGLSAGRVQSVATRLVVQRERERIAFVPADYWDLTGQFSRPEGQDAGRAFSARLSSVNGRRVATGKDFDDRGQLKSPSSGNAPVTLDEAVATALAAGLQDAPFSVRSLETKPYTRRPAAPFTTSTLQQEAARKLRFTSRTTMRVAQRLYENGYITYMRTDSVALSDQAVNAARAQAKELYGPEFVPSSKRVYASKSKNAQEAHEAVRPAGDTFRTPSQVRSQLSVDEYKLYELIWKRTVASQMQDAKGDTATVRLGATATSAAGEHAGADAEFSASGTVITFRGFLAAYEEGRDVNPDLTADSGKKGAKDEDKRLPVMAEGDALDASEVTADGHTTTPPARYTEASLVKTLDELGIGRPSTYAATISTIMDRGYVQVRGSALIPSWLAFSVVRLLEDHFSDYVDYDFTAELEDDLDRIARGEAERVKWLSGFYFGENPSEPGLKPIVDDLGEIDARAVNSIPITDEITLRVGKYGPYLEAGGTVDPETGEITDPVRANVPLDLAPDELTPEKAQELMEIGKADGRELGVNPANGRTIVAKDGRYGPYVTEIVPEPTQEELDAIPTEYYKNGNPKPKKIEKPKPNTASLFSSMNLQDITLDDALKLLSLPRELGQDTDGETITVQNGRYGPYLKKGSDSRSISSEDQIFTITLEEAKTIYAQPKQRGRQAARPPLADLGADPLTEKRMVIKEGRFGAYITDGETNVTVPRAEAVEQITAARASQLLAEKRAKGPAPAKSPARGKARTASKSSTSKASASKGTSSKAKAGTTTAKRASATKAKSTTGAARTTRKAPAKKSS
(1227) DNA topoisomerase 1 [Rothia dentocariosa ATCC 17931]
8
MRRAVPTKAKNGKALLIVESPSKVKTISGYLGNEFLVDSSMGHIRDLPQPSELPENLKKGPVGKFAVNIDDDFDPYYVVNPDKKKKVAELKRKLKDVDALYLATDGDREGEAIAWHLKEVLKPKVPVYRMTFPEITREAIERAFGELRDIDLHLVDAQETRRILDRIYGYEISPVLWRKVGRGLSAGRVQSVATRLVVERERERMAFVAANYWDLTGHFITTSNEGFDAKLVAVDGTRVATGKDFADDGTLTSTKVTHLSEADARTLAEALTAAPFAVRSVETKPYKRRPAAPFTTSTLQQEAARKLRFSSRVTMQVAQRLYESGYITYMRTDSVALSDQAVKAARRQASELYGTEYVPSAPRTYASKSKNAQEAHEAIRPAGDKFRTPDAVRGTLSNDEYRLYELIWKRTIASQMADATGSTASVRLGATASNGRDAEFAASGTVITFRGFLAAYEEGVDATRLAERDAKNAEKRLPALAQGDSLTAEKLEATGHETLPPPRYTEASLVKTLDELGIGRPSTYAAVISTIMDRGYVQVRSGSLVPSWTAFSVVRLLETSFGPYVNYEFTAQMEEDLDRIARGEESRVEWLGDFYFGGGVQKKRGLKPIVDNLGDIDARDINSIRIADGIVLRVGKFGPYLEAEGTVNTETGEVSDPVRANVPTDLAPDELTAEKAKELLEQGKSDGRVLGTDPASGNQIIARDGRYGPYVTEVIEEMTEEQIQAYLDAQPTEYYKNGKPKPKKKPKPAKPRTASLFKSMDLATLTLEDALKLLSLPRVLGTDAEGNEITVQNGRFGPYLKKGTDSRSIGSEEEIFTITLEQALDIYAQPKQRGRAAAKPPLAELGVDPNSEKNIVVKDGRFGPYITDGVTNITVPRSETIESLTHERAVELLAEKRAKGPAKRKTAAKKTTAKKSTAKKTTAKKSTTAKKTAAKKE
(1408) DNA topoisomerase 1 [Rothia mucilaginosa DY-18]
8
MPAQAKTGKALLIVESPSKVKTISSYLGEDYLVDSSMGHIRDLPQPSELPENLKKSPVGKFAVNVEENFEPYYVVNPDKKKKVAELKRKLKEVDALYLATDGDREGEAIAWHLKEVLKPKVPVYRMTFPEITREAIQRAFGELRDIDLHLVDAQETRRILDRIYGYEISPVLWRKVGRGLSAGRVQSVATRLVVERERERMAFVAANYWDLSGRFLTAASEGFDAKLVAVDGNRIATGKDFADNGTLNTSKVTHLNEEAARALAAALQSAAFSVRSVETKPYKRRPAAPFTTSTLQQEAARKLRFSSRVTMQVAQRLYENGYITYMRTDSVALSEQAISAARRQASELYGAEFVPSAPRVYTSKSKNAQEAHEAIRPAGDTFRTPDAVRGSLSNDEFRLYELIWKRTVASQMADATGSTASVRLGAVASNGQDAEFAASGTVITFRGFLAAYEEGVDASRVAEREAKDAEKRLPNLTTGEALTAEAIEPAGHETLPPPRYTEASLVKTLDELGIGRPSTYAAVISTIMDRGYVNVRSGSLIPSWIAFSVVRLLESSFGPYVNYEFTAQMEEDLDRIARGEESRVEWLGEFYFGGGSKRGLKPIVDNLGEIDARSINSIPIADGIVLRVGKFGPYLEAEGTLDTETGELTEPIRANVPADLAPDELTEEKARELLEQGKSDGRVLGVDPVSGNQIVARDGRYGPYVTEVIEEMTEEQIQAYLDAQPTEYYKNGKPKPKKKPKPAKPRTASLFKSMDLATVTLEQALQLMSLPRVLGTDAEGVEITVQNGRFGPYLKKGTDSRSIGSEDEIFTITLEQALEIYSQPKQRGRAAAKPPLAELGVDPVSEKKIVVKDGRFGPYITDGITNITVPRAESVESLTHERAVQLLADKRAKGPVKRKTAAKKTTTAKKTTAKKTTTRKTAAKKTAE
(44) DNA topoisomerase 1 [Arthrobacter sp. FB24]
8
MPSKAKTGKKLVIVESPAKSKTIAKYLGEGFIVEASIGHIRDLPQPSELPAELKKTSIGKFAVDIEHDFKPYYVVSPDKKKKVTELKAALKDADALYLATDGDREGEAIAWHLLEVLKPKVPVYRMTFGEITKEAIQRAMGNLRDVDQDLVDAQETRRVLDRLYGYEISPVLWRKVARGLSAGRVQSVVTRMVVDRERERMAFKAASYWDLTGQFGAGNGATSSFKAKLAAVDGAKVASGRDFNDDGELTSRNVTHLNEELATSLAAGLQNAEFRVRSVDTKPYTRRPAAPFTTSTLQQEAGRKLRFSSKSTMQVAQRLYENGYITYMRTDSSALSDEAVTAARRQASELYGPEYIPQSPRVYTGKAANAQEAHEAIRPAGDSFRTPAQVAKQLSGDEFRLYELIWKRTVASQMGDAKGSTATIRLGAVAADGRDAEFSASGTVITFPGFLAAYEEGKDESRGDDDSEEARRLPNVAKDDALTASEIVAVGHETSPPPRYTEASLTAELEKKGIGRPSTYASTISTIQDRGYVRKQGSALVPSWIAFSVIRLLEQHFHDYVDYEFTADMEGDLDKIANGQAVGAAWLKHFYYGEDSDPGLLSIVNNLGEIDAREINSVPIAEGITLRVGKFGPYLESSVPTIDPKTGEVVESARANVPEDLAPDELTAAKAKELMETAAPEERVLGEDPHTGHTIVAKNGRYGAYVTEIIPEMTDEQLANQPVEYYKNGKPKPPKKPVKAKPRTGSLFASMSVDSVSLDEALQLMSLPRALGQDAEGNVITVQNGRFGPYLKKGTDSRSIGSEEEIFTITLEQALEIYSQPKQRGARAAVPPLAEFGPDPVSEKNIVVKEGRFGPYITDGITNITVPRSTSLEELTREQAVELLAEKRAKGPAKRPAARKAPAKKKAVAKK
(1425) DNA topoisomerase 1 [Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3]
8
MPSKAKTGKKLVIVESPAKSKTIAKYLGEGFIVEASIGHIRDLPQPSELPAELKKTSVGKFAVDIEHDFKPYYVVSADKKKKVTELKAALKDADELYLATDGDREGEAIAWHLLEVLKPKVPVYRMTFGEITKEAIQRAMGNLRDVDTALVDAQETRRILDRLYGYEISPVLWRKVARGLSAGRVQSVVTRMVVDRERERMAFKAASYWDLTGQFGSDAGSFKAKLAAVDGAKVASGRDFNDDGVLTSKNVAHLNEELATSLAAGLQDASFTVRSVDTKPYTRRPAAPFTTSTLQQEAGRKLRFSSKSTMQVAQRLYENGYITYMRTDSSALSDEAVTAARRQASELYGPEYIPQSPRVYTGKAANAQEAHEAIRPAGDSFRTPAQVAKQLSGDEFRLYELIWKRTVASQMADAKGSTATIRLGAVAVDGRDAEFSASGTVITFPGFLAAYEEGKDETRGDDDSDEARRLPNVAKGDSLAASEIVAVGHETSPPPRYTEASLTAELEKRGIGRPSTYASTISTIQDRGYVRKQGSALVPSWIAFSVIRLLEQHFSDYVDYEFTADMEGDLDKIANGQAVGASWLRHFYFGEDSDPGLLSIVNNLGEIDAREINSIPITDEITLRVGKFGPYLESSAATVDPKTGEIVESARANVPEDLAPDELTAAKAVELMETAAPEERVLGTDPHTGHTIVAKNGRYGAYVTEIIPEMTEEQIAAQPVEYYKNGKPKPPKKPVKAKPRTGSLFKSMTVESVTLDEALQLMSLPRVLGEDAEGNLITVQNGRFGPYLKKGTDSRSIGSEEEIFTITLEQALEIYSQPKQRGARAAVPPLAEFGPDPVSEKNIVVKEGRFGPYITDGITNITVPRATSLEELTREQAVELLAEKRAKGPVKRTATRKAPAKKKATAKK
(1697) DNA topoisomerase 1 [Arthrobacter aurescens TC1]
8
MPSKAKTGKKLVIVESPAKSKTIAKYLGEGFIVEASIGHIRDLPQPSDLPAELKKTSLGKFAVDIENDFKPYYVVSPDKKKKVAELKAQLKDADALYLATDGDREGEAIAWHLLEVLKPKVPVYRMTFGEITKEAIHRAMDNLRDVDTALVDAQETRRILDRLYGYEISPVLWRKVARGLSAGRVQSVVTRMVVDRERERMAFRAASYWDLTGQFGSDSGSFKAKLAAVDGSKVASGRDFNDNGQLTSSTVVHLNEELATSLAAGLENAEFRVRSVDTKPYTRRPAAPFTTSTLQQEAGRKLRFSSKSTMQVAQRLYENGYITYMRTDSSALSDEALTAARRQASELYGPEYVPQSPRVYANKAANAQEAHEAIRPAGDSFRTPAQVAKQLSGDEFRLYELIWKRTVASQMADAKGSTATIRLGAVAADGRDAEFSASGTVITFPGFLAAYEEGKDESRGDEESDEARRLPNVAKGDSLTASDILAVGHETSPPPRYTEASLTAELEKRGIGRPSTYASTISTIQDRGYVRKQGSALVPSWIAFSVIRLLEQHFTDYVDYEFTADMEGDLDKIANGQAVGAAWLKHFYYGEDADPGLLSIVNNLGEIDAREINSVPIAEGITLRVGKFGPYLESSIPTLDAKTGEVVESARANVPEELAPDELTADKAKELMETAAPEERVLGTDPHTGHTIVAKNGRYGAYVTEIIPEMTEEQLANQPVEYYKNGKPKPPKKPVKAKPRTGSLFKSMTVDTVTLDEALALMSLPRVLGEDADGNPITVQNGRFGPYLKKGTDSRSIGSEEEIFTITLEQALEIYSQPKQRGARASVPPLAEFGPDPVSEKNIVVKEGRFGPYITDGVTNITVPRSTSLEELTRERAVELLAEKRAKGPVKRTTTRKAPAKKATAKK
(745) DNA topoisomerase 1 [Renibacterium salmoninarum ATCC 33209]
8
MPTKASSKRALTGKKLVIVESPAKGKTISGYLGEGFEVEASYGHIRDLPQPSDLPAELKKSSVGKFAVDLDNNFEPYYVVPGDKKKRVAELKAALKDADELYLATDGDREGEAIAWHLLEVLKPKVPVYRLTFPEITKEAIQRAMGELRDVDMPMVDAQETRRVLDRLYGYEISPVLWRKVSRGLSAGRVQSVATRLVVERERERMAFRSASYWDLSGEFTPENSAQAFKAKLVALDGARVATGRDFNDTGVLTSKNVAHLDEAIAAALAAGLQQAKFAVRSVENKPYTRRPAAPFTTSTLQQEAARKLWFSARVTMRVAQSLYENGYITYMRTDSTALSSQAVNAARRQAAELYDPSFVPDAPRVYAGKAKNAQEAHEAIRPAGDSFRIPAQVAKALSSDEFKLYELIWKRTVASQMADAKGSTASVRLGAVATGGQNAEFSASGTVITFQGFLAAYEEGRDEGRNKDDADSDGGRLPNLAAQDALTATEIEPLGHETSPPPRYTEASLVKTLEERGIGRPSTYAATISTIMDRGYVSQRGSALVPSWVAFSVVRLLEQYFQNYVDYDFTAGMEEDLDRISRGEETGPHWLKLFYFGDEDGSGLLPIVNNLGEIDAREINSVPISDGITLRVGKFGPYLEKPVPADAPEGTEPERANVPEDLAPDELTAEKAIELINTAAPEERVLGVDPISGHSVVAKNGRYGAYVTELIPEPTAEDLANAPVEYYKNGKPKPAKKPVKAKPRTGSLFASMSVENVSLDEALQLMSLPRVLGADAEGNEITVQNGRFGPYLKKGSDSRSIGSEEEIFTITLEQALEIYSQPKQRGARAAVPPLAEFGDDPTSGKKIVVKEGRFGPYITDGETNITVPRSTSIEELTRERAVELLADKRAKGPVKRPAKRPAAKAKAGSRR
Family distribution
Taxonomy tree
Micrococcaceae