Toggle navigation
TopoIBase
Data
Taxonomy and VLD families
Downloads
My selection
Upload to selection
Selection 1
Selection 2
Selection 3
Tools
Blast
MUSCLE
VLD
About
How to use
Acknowledgements and references
Contact
Tests
Search more
Download
fasta
tsv
Download
Blast
Muscle
VLD
Add to selection
Selection 1
Selection 2
Selection 3
All selections
Taxon : Borrelia
Informations
Name
Borrelia
Rank
genus
# topoisomerases
9
Lineage and sub-taxa
Lineage
Bacteria
>
Spirochaetes
>
Spirochaetia
>
Spirochaetales
>
Spirochaetaceae
>
Borrelia
Sub-taxa
Topoisomerases
Select all
Name
Family
Sequence
(185) DNA topoisomerase 1 [Borrelia afzelii PKo]
1
MQKKKLIIVESPTKAKTIKKFLDNSFLVEACIGHIVDLPNNAKEIPKEYKKYEWANISIDYNNGFDPIYIIPSNKKPIVSKLKKLVKTINEIYLATDQDREGETIAFHLKEVLKIKNYKRMIFHEITETAITESLKNTRNIDMNLVNAGEARRLLDRLYGYTISPLLWKKIAYGLSAGRVQSVGLKLLIEKERTRINFKKANYYSILLQCKHEKKDLLLETKLEEIDGKNIAEGKDFTNETGKLKNSAKSIIITQDLMIELEKELENGQKIELISIETKKINIPPPKPFTTSTLQQEINKRLKIGTKQIMQHAQKLYEHGYITYMRTDSHNIAKIAKDKITKIIKNIYGKDYIEKKDRIYKKEKMTQNAHEAIRPSEMFIPNENIEIESKTAKEIYKIIWDRTIISGMKDAIKENIKLTFKYKNLIFKSNFTKIIFDGFLKHTKEKDEHLNINFDLIKKGDIFSIVKMQTSEHETKPPFRYTEASLVQKMEKEGIGRPSTYSTIISTLLEREYAFKLNNTLIPTIKGAAVINLLEKYFPVLIELNFTSNMEEKLDKIAIGKLDKIKYLSKFYNGKKGLKDTVMQLEPKINSSEFRTVIESQNLENKDNSINYTINIGKYGPYLIFKGHNYSIITTTPLENLYKKDKIEKIINEKELKPNILGIDPLTGLNVIFKNTIYGSIVQLGEDTYAPQEYTKKGKPKKLKIIKAKKASAKKIDPENMTLELALKLLSLPKLIGKHPQTNEQIIAATGVFGDYIKTESGSIACSLKKDEKAYDITLDKAISLLNERVNKVGIIVKMIAFSKNKIGNKIYIYKKNDRFYAKIKRKKIDLPDNINLDEINEKYVFNLL
(1629) DNA topoisomerase 1 [Borrelia afzelii PKo]
1
MQKKKLIIVESPTKAKTIKKFLDNSFLVEACIGHIVDLPNNAKEIPKEYKKYEWANISIDYNNGFDPIYIIPSNKKPIVSKLKKLVKTINEIYLATDQDREGETIAFHLKEVLKIKNYKRMIFHEITETAITESLKNTRNIDMNLVNAGEARRLLDRLYGYTISPLLWKKIAYGLSAGRVQSVGLKLLIEKERTRINFKKANYYSILLQCKHEKKDLLLETKLEEIDGKNIAEGKDFTNETGKLKNSAKSIIITQDLMIELEKELENGQKIELISIETKKINIPPPKPFTTSTLQQEINKRLKIGTKQIMQHAQKLYEHGYITYMRTDSHNIAKIAKDKITKIIKNIYGKDYIEKKDRIYKKEKMTQNAHEAIRPSEMFIPNENIEIESKTAKEIYKIIWDRTIISGMKDAIKENIKLTFKYKNLIFKSNFTKIIFDGFLKHTKEKDEHLNINFDLIKKGDIFSIVKMQTSEHETKPPFRYTEASLVQKMEKEGIGRPSTYSTIISTLLEREYAFKLNNTLIPTIKGAAVINLLEKYFPVLIELNFTSNMEEKLDKIAIGKLDKIKYLSKFYNGKKGLKDTVMQLEPKINSSEFRTVIESQNLENKDNSINYTINIGKYGPYLIFKGHNYSIITTTPLENLYKKDEIEKIINEKELKPNILGIDPLTGLNVIFKNTIYGSIVQLGEDTYAPQEYTKKGKPKKLKIIKAKKASAKKIDPENMTLELALKLLSLPKLIGKHPQTNEQIIAATGVFGDYIKTESGSIACSLKKDEKAYDITLDKAISLLNERVNKVGIIVKMIAFSKNKIGNKIYIYKKNDRFYAKIKRKKIDLPDNINLDEINEKYVFNLL
(188) DNA topoisomerase 1 [Borrelia duttonii Ly]
1
MQQKRLIIVESPTKATTIKKYLDSSFSVEACIGHIRDLPNSAKEIPEEYKKFEWANLSIDYQNDFKPLYIIPSNKKMIIEKLKKLIKDQDEIYLATDQDREGETIAFHLKEVLQIKNYKRMVFHEITKSAIIDSLNNTREINMNLVNAGETRRILDRLYGYTISPLLWKKIAYGLSAGRVQSVGLQLIIEKEKSRINFKKANYYSITLECKHNKNNIQLKPTLEKIDNKNVAESKDFENDTGTLHEPNKTILIDKILMNSITKELKQINNIEVISIETKEIKLTPPKPFITSSLQQEINRRLKIGTKQIMSYAQKLYESGYITYMRTDSYEIAKTAKEKIKNIIRQKYGEEYIEKNDRMYTKAKMAQDAHEAIRPSEMFTPPEQIQIESETAKEIYKIIWDRTIESCMKDAIKKMGKIKFKYKNLTFKANFTKLIFDGFLKNNKEFHEDNIIDFSLIKEGDKFTILNIKPEQHETKPPLRYTEASLVQKLEKEGIGRPSTYATIISTLFEREYVFKQNNTLIPTIKGAAVINLLKKYFPILIELQFTSNMEENLDKIAIGKLDKIQYLNAFYNGKEGLKNTVSKIEPMISPEEFRMVYEYNNDKQFNYKINIGKFGPYLIFNGNNYAINLTTPLENLYKKDEIQKIITEKEIQPNILGVDPATGLNIIYKNSKYGGIIQLGEDIYEPQGFTKTGKPKKPKIIKAKKVSTKNIEYENITLELALQLLSLPKVIGKYPKTNEKIIATTGIFGDYIKTENDSIICPLKKDMKAYKITLEESIKLLDTKLAKNGIIVKIISLSKNKIGNKIYIYKQNDKFYAKIKRKKVDLPTNIDLNQIDATYVFGLM
(6) DNA topoisomerase 1 [Borrelia burgdorferi B31]
1
MQNKKLIIVESPTKAKTIKKFLDESFLVEACIGHVVDLPNNAKEIPKEYKKYEWANISIDYNNGFNPIYIIPSNKKPIVSKLKKLVKTINEIYLATDQDREGETIAFHLKEVLKIKNYKRMIFHEITETAITESLKNTRNIDMNLVNAGEARRILDRLYGYTISPLLWKKVAYGLSAGRVQSVGLKLLIEKEKTRINFKKANYYSILLQCKHEKKNLLLEAKLEEIDGKNIAEGKDFVNETGKLKNIAKTTIITQDLMIELEKELKNGQKIELISIETKKIKIPPPKPFTTSTLQQEINKRLKIGTKQIMQHAQKLYEHGYITYMRTDSHNIAKIAKDKITKIIKNKYGKEYIEEKDRIYEKEKMAQNAHEAIRPSEIFIPNETIEIESKTAKEIYKIIWDRTIISGMKDAIKENIKLTFKYKNLIFRSSFTKIIFDGFLKHTKEQDEHLNINFDLIKKGDTFSIVKMKTSEHETKAPFRYTEASLVQKMEKEGIGRPSTYSTIISTLLEREYAFKLNNTLMPTIKGAAVINLLEKYFPVLIELNFTSNMEEKLDKIAIGKLDKIKYLSKFYNGKKGLKDTVMQLEPKIDSSEFRTVIESQKIENKNSINYTINIGKYGPYLIFKGHNYSINAKTPLENLYKKDEIEKIINEKELKPNILGVDPLTGLNVIFKNTIYGNIVQLGEDTHAPQEYTKKGKPKKLKIIKAKKASTKKIDPENITLELALKLLSLPKPIGKHPQTNEQIIAATGVFGDYIKTESGSIACSLKKDLKAYDITLDKAISLLNERANKVGIIVKTITFSKNKIGNKIYIYKKNDKFYAKIKRKKIDLPDNINLEEINEKYVFSLL
(1069) DNA topoisomerase 1 [Borrelia garinii BgVir]
1
MQNKKLIIVESPTKAKTIKKFLDDSFLVEACIGHIVDLPNNAKEVPKEYKKYEWANISIDYNNGFNPIYIIPSNKKPIVSKLKKLVKTINEIYLATDQDREGETIAFHLKEVLKIKNYKRMIFHEITETAITESLKNTRNIDINLVNAGETRRILDRLYGYTISPLLWKKVAYGLSAGRVQSVGLKLLIEKEKTRINFKKANYYSISLQCKHDKKDLLLETKLEEIDGKNIAESKDFINETGKLKNSDKTIIITHDLMIELEKELENGQKIELISIETKKIKIPPPKPFTTSTLQQEINKRLKIGTKQIMQHAQKLYEHGYITYMRTDSHNIAKIARDKITKIIKNKYGKEYVEEKDRIYEKEKMAQNAHEAIRPSEMFIPNENIEIEGKTAKEIYKIIWDRTIISGMKDAIKENIKLTFKYKNLIFKSSFTKVIFDGFLKHTKEKDEYPNINFDLMKKGDIFYIVKMKTSEHETKAPFRYTEASLVQKMEKEGIGRPSTYSTIISTLLEREYAFKLNNTLIPTVKGAAVINLLEKYFPVLIELNFTSNMEEKLDKIAIGKLDKIKYLSKFYNGKKGLKDTVMRLEPKINSSEFRTVIESQNVENKDNDINYTINIGKYGPYLIFKGHNYSINTTTPLENLYKKDEIEKIINEKELKPNILGVDPLTGLNVIFKNTIYGNIVQLGEDTYAHQEYTKKGKPKKLKIIKAKKASTKKIDPENITLELALKLLSLPKPIGKHPQTNEQIIAATGVFGDYIKTESGSIACSLKKDVKAYDITLDRAISLLDERVNKVGIIVKTITFSKNKIGNKIYIYKKNDKFYAKIKRKKIDLPDNINLDEINEKYVFSLL
(565) DNA topoisomerase 1 [Borrelia bissettii DN127]
1
MENKKLIIVESPTKAKTIKKFLDESFLVEACIGHIVDLPNNAKEIPKEYKKYEWANISIDYNNGFNPIYIIPSNKRPIVSKLKKLVKTINEIYLATDQDREGETIAFHLKEVLKIKNYKRMIFHEITETAITESLKNTRNIDMNLVNAGEARRILDRLYGYTISPLLWKKVAYGLSAGRVQSVGLKLLIEKEKTRINFKKANYYSILLQCKHEKKDLLLETKLEEIEGKNIAEGKDFINETGKLKNITKTIIITQDLMVELEKELKNGQKIELISIETKKIKIPPPKPFTTSTLQQEINKHLKIGTKQIMQHAQKLYEHGYITYMRTDSHNIAKIAKDKITKIIKNKYGKDYVEEKDRIYEKEKMAQNAHEAIRPSEMFIPNETIEIESKTAKEIYKIIWDRTIISGMKDAIKENIKLTFKYKNLIFRSSFTKIIFDGFLKHTKEKDECLNINFDLIKKGDTFSIVKMKPNEHETKAPFRYTEASLVQKMEKEGIGRPSTYSTIISTLLEREYAFKLNNTLMPTIKGAAVINLLEKYFPVLIELNFTSNMEEKLDKIAVGKLDKIKYLSKFYNGKKGLKDTVMQLEPKIDSSEFRTVIESQDIENKNDNSINYTINIGKYGPYLIFKGHNYSINTKTPLENLYKKDEIEKIINEKELKPNILGIDPLTGLNVIFKNTIYGNIVQLGEDTYAPQEYTKKGKPKKLKIIKAKKASTKKIDPENITLELALKLLSLPKPIGKHPQTNEQIIAATGVFGDYIKTESGSIACSLKKDLKAYDITLDKAISLLNERANKVGIIVKIITFSKNKIGNKIYIYKKNDTFYAKIKRKKIDLPDNINLDEVNEKYVFSLL
(799) DNA topoisomerase 1 [Borrelia hermsii HS1]
1
MQQRKLIIVESPTKATTIKKYLDNSFSVEACIGHIRDLPNSAKEIPDEYKKFEWANLSIDYQNDFKPLYIIPSNKKTVIEKLKNLIKEQDEIYLATDQDREGETIAFHLKEVLQIKNYKRMVFHEITKSAIIDSLNNTREINMNLVNAGETRRIIDRLYGYTISPLLWKKIAYGLSAGRVQSVGLQLIIEKEMARINFKKANYYSITLECKHNKNDIQIKTTLEKIENKNVAESKDFVNDTGVLHNPDKTIAIDKTLMNVLTKELKKTKEIEVISIETKETKQAPPKPFITSSLQQEVNRRLKIGTKQIMNYAQKLYERGYITYMRTDSYNIAKTAREKIKNIIKQKYGEEYIETNDRVYVKVKMAQDAHESIRPSEMFTPPEQIQIESETAREIYKIIWDRTIESVMKDAIKKVIKITLKYENLTFKASFTNLIFDGFLKNNKESYENNIMDFSLIKEGDKFIILDIKPEEHETKPPLRYTEASLVQKLEKEGIGRPSTYSTIISTLFEREYIFKQNNTLIPTIKGAAVTNLLKKYFPVLIELKFTSHMEENLDKIAIGTLDKIKYLNKFYNGEEGLKNTVNKIEPIISPEEFRIVHEYNNDEKFNYKINIGKFGPYLIFNGNNYSINVTTPLENLYKEDEIKKIIAEKEIQPNILGVDPVTGLNVIYKNSKYGGIVQLGEDVYAPQEFTKTGKPKKPKIIKAKKVSTKNIEYENLTLELALKLLSLPKVIGEYPQTHEKIIATTGIFGDYIKTENNSIICPLKKDMKAYDITLEESIKLLDAKLEKNGIIVKTIPLSKNKVGNKIYVYRQNDKLYAKIKRKKVDLPTNIDLDQIDAAYVCGLM
(1655) DNA topoisomerase 1 [Borrelia turicatae 91E135]
1
MQQRKLIIVESPTKAITIKKYLDNSFLVEACIGHIRDLPNSAKEIPEEYKKFEWATLSIDHQNDFKPLYIIPNNKKTVIEKLKNLIKEKDEIYLATDQDREGETIAFHLKEVLQIKNYKRMVFHEITKSAIIDSLNNTREINMNLVNAGETRRILDRLYGYTISPLLWKKIAYGLSAGRVQSVGLQLIIEKEMTRINFKKANYYSITLECKHNKNDIQIKTILEKIKNKNVAESKDFVNDTGALHDPDKTIVIDKTLMNMLTKKLNNTKEIEVISIETKEIKQAPPKPFITSSLQQEVNRRLKIGTKQIMNYAQKLYENGYITYIRTDSYHIAKTAREKIKTIIKQKYGEEYIETNDRLYAKAKMAQDAHEAIRPSELFTSPEQIQIESETAREIYKIIWDRTIESVMKDARKKIIKITLKYENLTFKTSFTTIIFDGFLKNSKEPYENSIIDFSLIKEGDKFVILDVNPEEHETKPPLRYTEASLVQKLEKEGIGRPSTYSTIISTLFEREYIFKHNNTLIPTIKGAAVINLLKKYFPVLIELKFTSHMEENLDKIAIGTLDKIKYLNKFYNGEEGLKNTINKIEPIISPEEFRIVYEYTNNEKFSYKVNLGKFGPYLIFNGNNYAINVTTPLENLYKEDEIKKIISEKEIQPNILGIDPETGLNVIYKNSKYGGIVQLGEDIYAPQEFTKTGKPKKPKIIKAKKMSTKNIEHENITLELALKLLSLPKIIGEYPKTHEKIIATTGVFGDYIKTENNSIICPLKKDIKAYEITLEESIKLLDAKLEKNGIIVKIIPLAKNKVGNKIYVYKQNDRFYAKIKRKKVDLPTDIDLNQIDATYIFGLM
(643) DNA topoisomerase 1 [Borrelia recurrentis A1]
1
MQQKRLIIVESPTKATTIKKYLDSSFSVEACIGHIRDLPNSAKEIPEEYKKFEWANLSIDYQNDFKPLYIIPSNKKMIIEKLKKVIKDQDEIYLATDQDREGETIAFHLKEVLQIKNYKRMVFHEITKSAIIDSLNNTREINMNLVNAGETRRILDRLYGYTISPLLWKKIAYGLSAGRVQSVGLQLIIEKEKSRINFKKANYYSITLECKHNKNNIQLKPTLEKIDNKNVAESKDFENDTGTLHEPNKTILIDKILMNSITKELKQINNIEVISIETKEIKLTPPKPFITSSLQQEINRRLKIGTKQIMSYAQKLYESGYITYMRTDSYEIAKTAKEKIKNIIRQKYGEEYIEKNDRMYTKAKMAQDAHEAIRPSEMFTPPEQIQIESETAKEIYKIIWDRTIESCMKDAIKKMGKIKFKYKNFTFKANFTKLIFDGFLKNNKEFHEDNIIDFSLIKEGDKFTILNIKPEQHETKPPLRYTEASLVQKLEKEGIGRPSTYATIISTLFEREYVFKQNNTLIPTIKGAAVINLLKKYFPILIELQFTSNMEENLDKIAIGKLDKIQYLNAFYNGKEGLKNTVSKIEPMISPEEFRMVYEYNNDKQFNYKINIGKFGPYLIFNGNNYAINLTTPLENLYKKDEIQKIITEKEIQPNILGVDPATGLNIIYKNSKYGGIIQLGEDIYEPQGFTKTGKPKKPKIIKAKKVSTKNIEYENITLELALQLLSLPKVIGKYPKTNEKIIATTGIFGDYIKTENDSIICPLKKDMKAYKITLEESIKLLDTKLAKNGIIVKIISLSKNKIGNKIYIYKQNDKFYAKIKRKKVNLPTNIDLNQIDATYVFGLM
Family distribution
Taxonomy tree
Borrelia