Toggle navigation
TopoIBase
Data
Taxonomy and VLD families
Downloads
My selection
Upload to selection
Selection 1
Selection 2
Selection 3
Tools
Blast
MUSCLE
VLD
About
How to use
Acknowledgements and references
Contact
Tests
Search more
Download
fasta
tsv
Download
Blast
Muscle
VLD
Add to selection
Selection 1
Selection 2
Selection 3
All selections
Taxon : Xanthomonadaceae
Informations
Name
Xanthomonadaceae
Rank
family
# topoisomerases
11
Lineage and sub-taxa
Lineage
Bacteria
>
Proteobacteria
>
Gammaproteobacteria
>
Xanthomonadales
>
Xanthomonadaceae
Sub-taxa
Topoisomerases
Select all
Name
Family
Sequence
(624) DNA topoisomerase 1 [Pseudoxanthomonas suwonensis 11-1]
1
MPKHLLIVESPAKAKTINKYLGKDFTVLASYGHVRDLVPKEGAVDPERGFAMRYDLIEKNEKHVEAIAKAARSADDIWLATDPDREGEAISWHIAEILKERGLLDGKPLRRVVFTEITPRAIKEAMTQPRTIAGELVDAQQARRALDYLVGFNLSPVLWRKVQPGLSAGRVQSPALRMIVEREEEIEAFKAREYWSIGAELAHAAQPFSAKLVKLDGQKFEQFTITDGESAEAARLRIQQAAAGALHVTDVASKERKRRPAPPFTTSTLQQEASRKLGFTTRKTMQVAQKLYEGVTLGEEGTVGLISYMRTDSVNLSQEAVAEIRDVIARDYGTASVPDKPNTYQTKSKNAQEAHEAIRPTSALRTPGSVARFLTDDERRLYELVWKRAVASQMVPATLNTVSVDLAAGSDHVFRASGTTVVFPGFLAVYEEGKDTKTAEDEDEGRKLPPLKPGERVPLDRIHADQHFTQPPPRFTEAALVKALEEYGIGRPSTYASIIQTLLFRKYAEMEGRAFRPTDVGRAVSKFLSGHFTRYVDYDFTARLEDELDAVSRGEEEWVPLMERFWAPFKELVEDKKESLDRTDAGSSRSLGIDPKSGKEVSARIGRFGPMVQIGTVDDEEKPKFASLQPGQSIYSISLEDALKLFDMPRNLGESNGQQVSVGIGRFGPFAKRGSTYASLKKEDDPYKIDLARAVELIEEKEEIARNRIIKEFPGSDIQVLNGRFGPYISDGKLNGKIPKDREPSTLTLEEVQQLLAETGKPARRGFGAKKAVARKAATKTAASKEAAPKKALAKKAPAKKAAKKATRKAAAKKAPAKKAAARATADDAPPF
(386) DNA topoisomerase 1 [Xylella fastidiosa 9a5c]
1
MPKHLLIVESPAKAKTINKYLGKDFTVLASYGHVRDLVPKEGAVDPENGFAMRYDLIDKNEKHVEAITKAAKTADSIYLATDPDREGEAISWHISEILKERGLLKDKPMQRIVFTEITPRAIKEAIQKPRMIASDLVDAQQARRALDYLVGFNLSPVLWRKVQRGLSAGRVQSPALRMIVEREEEIEAFITREYWSIHAECAHPAQHFSAKLIKLDGQKFEQFTITDSDTAAAAQRRIQQVAQGRLHITDVTNKERKRRPAPPFITSTLQQEASRKLGFTTRKTMQIAQKLYEGIALGEEGSVGLITYMRTDSVNLSLDALSEIRDIIARDYGTNALPDKPNVYTTKSKNAQEAHEAVRPTSALRTPTQVAPYLSNEEHRLYELVWKRAVASQMIPAILNTTSVDLAAGNEHVFRATGTTVVVQGFLAVYEEGKDNKNAEDDDEGRKLPVMKTGENVPLERILTEQHFTQPPPRYTEAALVKALEEYGIGRPSTYASIIQTLLFRKYVDMEGRSFRPTDIGRAVSKFLASHFTRYVDYDFTAHLEDELDAISRGEEEWIPLMKKFWVPFKELVEDKKDSLDKTDAGSVRLLGIDPTSGKEVSGRIGRFGPMVQIGTVDDEEKPRFASLRPNQSIYSISLEEAIELFKMPRVLGEDQSQQVSVGIGRFGPFAKRGSTYVSLKSEDDPYTIDLARATFLINEKEEIARNRIIKNFENSQIQVLNGRFGPYISDGKLNGKIPKDREPASLTLEEAQQLLIDTGKPARKNFSTKKTATKNETRKQTTKKRTTDAKATKKVSDKPVKKQIKKRIAPNITE
(1779) DNA topoisomerase [Xylella fastidiosa 9a5c]
4
MTRRSSAGRWSSCPLFRSSGGSRSNRRPPRNSKVVKALLAKATHLVIATDADREGELIAREIIDLCGYRGPIERLWLSALNDASIRTALGKLRPSSDTLPMYYSALARSRADWLVGMNLSRLFTVLGLQAGYDGVLSVGRVQTPTLKLVVDRDREIAAFKSVPFWAIDVSLSAGGQAFSAQWVPPDGCTDDAGRCLQQPIAQQAAQQIRAASSAQVVSVETERVREGPPLLFDLGTLQEVCSKQLGLDVQETLEIAQALYETHKATTYPRSDSGYLPESMFAEVPTVLDSLLKTDPSLRPIMGQLDRSQRSRAWNDGKVTAHHGIIPTLEPANLSAMSEKELAVYRLIRAHYLAQFLPHHEFDRTIAELSCGQQKLVATGKQVAAQGWHLVLAEPQADEDGETTARSQVLPALREGLACQVAEAEVKALKTLPPKPYTQGELVKSMKGVARFVTDPRLKQKLKDTTGIGTEATRANIITGLLTRGYLVKKGRSIRASDAAFTLIDAVPAAIADPGTTAVWEQALDMIEAGQLTLDVFIGKQAAWISQLIVQYGSTSLSIKVPQGPACPQCGAPTRQRTGKTGPFWSCSRYPDCKGTLPVDSGTSKRGASRPRSSGRKGS
(51) DNA topoisomerase 1 [Stenotrophomonas maltophilia R551-3]
1
MPKHLLIVESPAKAKTINKYLGKDYTVLASYGHVRDLIPKEGAVDPDNGFAMHYDVIDKNEKHVDAIAKAAKSADDILLATDPDREGEAISWHIAEILKERGLVKDKPMQRVVFTEITPRAIKEAISQPRAIASDLVDAQQARRALDYLVGFNLSPVLWRKVQRGLSAGRVQSPALRMIVEREEEIEAFIAREYWSIAAECAHPSQHFNAKLIKLDGQKFEQFTVTDGDTAEAARLRIQQAAQGALHVTDVASKERKRRPAPPFTTSTLQQEASRKLGFTTRKTMQVAQKLYEGVAIGDEGTVGLISYMRTDSVNLSQDALAEIRDVIARDYGIASLPDQPNTYQTKSKNAQEAHEAVRPTSALRTPAQVSRYLTDDERKLYELIWKRAVACQMIPATLNTVSVDLSAGSDHVFRASGTTVVVPGFLAVYEEGKDNKSAEDEDEGRKLPAMKPGDRIPLERIVADQHFTQPPPRFTEAALVKALEEYGIGRPSTYASIIQTLLFRKYVEMEGRSFRPSDVGRAVSKFLSSHFTRYVDYDFTAKLEDELDAVSRGEEEWIPLMSRFWEPFKELVEDKKESVDRAEASGARELGTDPKTGKPVSVRLGRFGPYAAIGSTAEDAEEKPKFASLRPGQSMHTITLEDALELFLMPRALGEDKGEDVSVGIGRFGPFAKRGSTYASLKKEDDPYTIDLARAVFLIEEKEEIARNRIIKEFEGSDIQVLNGRFGPYISDGRMNGKIPKDREPASLTLAEVQQLMEETGKPVRKGFGKKAAAKKAPAKKAAVKKEAAPKKAAAKKAPAKKTVKKAAAKKAPAKKAVKKAAK
(1318) DNA topoisomerase 1 [Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331]
1
MPKHLLIVESPAKAKTINKYLGKDFTVLASYGHVRDLVPKEGAVDPDNSFAMRYDLIEKNEKHVEAIARAAKGADDIFLATDPDREGEAISWHIAEILKERGLLKDKPMQRVVFTEITPRAIKEAMLKPRAIAADLVDAQQARRALDYLVGFNLSPVLWRKVQRGLSAGRVQSPALRMIVEREEEIEAFIAREYWSIDAHCRHPSQAFNARLIKLDGQKFEQFTVTDGDTAEAARLRIQQAAQGVLHVTDVASKERKRRPAPPFTTSTLQQEASRKLGFTTRKTMQVAQKLYEGVALGDEGSVGLISYMRTDSVNLSQDALSEIRDVIARDYGTASLPDQPNAYTTKSKNAQEAHEAVRPTSALRTPAQVARFLSDDERRLYELIWRRAVACQMIPATLNTVSVDLSAGSEHVFRASGTTVVVPGFLAVYEEGKDTKSSEDEDEGRKLPLMKAGDNIPLDRIVTDQHFTQPPPRFTEAALVKALEEYGIGRPSTYASIIQTLQFRKYVEMEGRSFRPTDVGRAVSKFLSGHFTRYVDYDFTAKLEDDLDAVSRGEAEWIPLMEKFWGPFKELVEDKKDSLDKTDAGSVRVLGTDPVSGKEVSARIGRFGPMVQIGSVEDEDKPTFASLRPGQSIYSISIEDALELFKMPRALGQDKDQDVSVGIGRFGPFARRGSVYASLKKEDDPYTIDLARAVFLIEEKEEIARNRVIKDFEGSDIQVLNGRFGPYISDGKLNGKIPRDREPASLTFEEVQQLLADTGKPVRKGFGAKKATLKKNAVKDSAPKKPAAKKTATKTAASKTAAKKAPAKKAAAEKGTKRVVKKTVSKAAD
(31) DNA topoisomerase 1 [Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913]
1
MPKHLLIVESPAKAKTINKYLGKDFTVLASYGHVRDLVPKEGAVDPDNGFAMRYDLIEKNEKHVEAIARAAKSADDIYLATDPDREGEAISWHIAEILKERGLLKDKTMQRVVFTEITPRAIKEAMLKPRAIAADLVDAQQARRALDYLVGFNLSPVLWRKVQRGLSAGRVQSPALRMIVEREEEIEAFIAREYWSIDAHCRHPSQPFNARLIKLDGQKFEQFTVTDGDTAEAARLRIQQAAQGVLHVTDVASKERKRRPAPPFTTSTLQQEASRKLGFTTRKTMQVAQKLYEGVALGDEGSVGLISYMRTDSVNLSQDALAEIRDVIARDFGTASLPDQPNAYTTKSKNAQEAHEAVRPTSALRTPAQVARFLSDDERRLYELIWRRAVACQMIPATLNTVSVDLSAGSEHVFRASGTTVVVAGFLAVYEEGKDTKSSEDEDEGRKLPLMKAGDNIPLDRIVTDQHFTQPPPRFTEAALVKALEEYGIGRPSTYASIIQTLQFRKYVEMEGRSFRPTDVGRAVSKFLSGHFTRYVDYDFTANLEDDLDAVSRGEAEWIPLMEKFWGPFKELVEDKKDSLDKTDAGSVRVLGADPVSGKEVSARIGRFGPMVQIGTVEDEDKPTFASLRPGQSIYSISIEDALELFKMPRALGQDKDQDVSVGIGRFGPFARRGSVYASLKKEDDPYTIDLARAVFLIEEKEEIARNRVIKEFDGSDIQVLNGRFGPYISDGKLNGKIPKDREPASLTFEEVQQLLADTGKPVRKGFGAKKATLKKNAVKDSAKEAKDAAKKTAAVKKVATKTAAKKAPAKKAAKKATKRVVKKAVSKAAG
(642) DNA topoisomerase [Pseudoxanthomonas spadix BD-a59]
4
MRVVLCEKPSQGKDIARVLGATQRGNGCYTGSGLGVTWGIGHLIETAPPEAYGEQYKRWALEPLPIIPQHWQVVVKAKTATQFKVVKQLLAQATDLVIATDADREGEMIARELIDYCGYRGPIQRLWLSALNDASIRKALGALKPSGETLPLYYSALARSRADWLIGMNLSRLFTVLGRQAGYSGVLSVGRVQTPTLKLVVDRDREIARFVSVPFWTIEVLLAHAGQSFVANWTPPAGCTDDAGRCLQQPVAQQADERMRAAVSAQVVSVETERMREGPPLPFDLGTLQEVCSKQLGLDVQETLDIAQSLYETHKATTYPRSDSGYLPENMLAEVPTVLDSLVKTDPSLRPLVAKLDPHQRSRAWNDAKVTAHHGIIPTLEPANLSALNDKELAVYRLIRAHYLAQFLPHHEFDRTVAQFACAGQSLTVVGKQIVVTGWRQVLAAPAPDEPDEDAQRSQVLPALHAGLSCPIGAVDLKALKTLPPKPYTQGELVKAMKGVARLVTDPRLKQKLKDTTGIGTEATRANIINGLLGRGYLLKKGRAIRASDAAFTLIDAVPPAIADPGTTAVWEQALDMIEARQMTLDAFIAKQSAWVAQLVQQYRTATLSIQLPPAPACPQCGSPMRQRTGKSGAFWSCSRYPDCKGTMAIESATGGKRSAPRKRRTAPKAS
(1405) DNA topoisomerase 1 [Pseudoxanthomonas spadix BD-a59]
1
MPKHLLIVESPAKAKTINKYLGKDFTVLASYGHVRDLVPKEGAVDPDNNFAMRYDLIEKNQKHVEAIAKAAKGADDIYLATDPDREGEAISWHIAEILKERNLIGNKPMHRVVFTEITPRAIKEAMARPRAIAGDLVDAQQARRALDYLVGFNLSPVLWRKVQRGLSAGRVQSPALRMIVEREEEIEAFIAREYWSIAAACAHPSQPFTAKLVKLDGQKFEQFTVTDGDTAEAARLRIQQAAQGVLHVTDVTSKERKRRPAPPFTTSTLQQEASRKLGFTTRKTMQVAQKLYEGVALGDEGAVGLISYMRTDSVNLSQDALNEIRDVIARDYGTASLPDQPNIYLTKSKNAQEAHEAVRPTSALRTPSQVARFLSDDERRLYELIWKRAVACQMIPATLNTVSVELAAGSAHSFRASGTTVVVPGFLAVYEEGKDTRSAEDEDEGRKLPAMKPGDSVPLDRIVAEQHFTQPPPRFTEAALVKTLEEYGIGRPSTYASIIQTLLFRKYVEMEGRSFRPSDVGRAVSKFLSGHFTRYVDYDFTAKLEDELDAVSRGEEDWIPLMARFWGPFSQLVEEKKESVDRAEASGARELGTDPKTGKPVSVRLGRFGPYAAIGSTAEDAEDKPRFASLRPGQSMHTISLEDALELFLMPRALGQDKGEEVSVGIGRFGPFAKRGSSYASLKKEDDPYTIDLARAVFLIEEKEEIARNRIIKTFPDSQIQVLNGRFGPYISDGKLNGKIPKDRDPASLTGEEVIRLLEETGKPVRKGFGAKTPQKGAKTTARKVTKKAEPAEKKPTASKAVKKATGKTARNPGKGTGAASKLAAKKTVAKKSVAKKAASQGAAPF
(1370) DNA topoisomerase [Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306]
4
MRVVLCEKPSQGKDIARVLGAHRREAGCLGGPGITVTWGSGHLIEAAPPEAYGEHFQRWTLPIVPPRWQWVVKARSAAQFKVVKRLLGEASELIIATDADREGEMIAREMIDYCGYRGPVQRLWLSALNDASIRKAFGALRASSETLSLYHCALARSRADWLVGINLTRLFTLLGRHAGHDGVLSVGRVQTPTLKLVVDRDREIAAFVPVPFWSIDVSLSAANVPFSAHWLAPRTATDDAGRCLRQSVARHAADAIRAAGTAQVVHTETERVREGPPLPFDLSTLQEVCSRRLGLEVQETLDIAQALYETHKATTYPRTDAGYLPENMLAEVPTVIQSLVKTDPALQPLIDRLDFRQRSRAWNDAKITAHHAIIPTLEPADISAMSAKELAVYRLIRAHYLAQFLPHHEFDRTVVRFRCGGETLQAVGKRIAVPGWQHAFSAPSLPHVAADGADTEGSDEAPREQMLPVLQEGISCQVSALDLKSLSTKPPRPYTQGELVKAMKTVARLVTDPRLKQKLKDTTGIGTEATRANIISGLLSRGFLIRKGRAVRASDTAMMLIDAVPAAIADPGTTAIWEQALDMIEARQMGLESFVEKQAAWVTQLVRQHLGTTLAIRSPEGPPCPLCGAATRQRTGRSGPFWSCSRYPDCKGTAPVAPAQAGPDGQKRSRSRGARAQR
(1404) DNA topoisomerase 1 [Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306]
1
MPKHLLIVESPAKAKTINKYLGKDFTVLASYGHVRDLVPKEGAVDPDNGFAMRYDLIEKNEKHVEAIARAAKGADDIFLATDPDREGEAISWHIAEILKERGLLKDKPMQRVVFTEITPRAIKEAMAKPRMIAGDLVDAQQARRALDYLVGFNLSPVLWRKVQRGLSAGRVQSPALRMIVEREEEIEAFIPREYWSIDAHCRHPSQAFNARLIKLDGQKFEQFTVTDGDTAEAARLRIQQAAQGVLHVTDVASKERKRRPAPPFTTSTLQQEASRKLGFTTRKTMQVAQKLYEGVALGDEGSVGLISYMRTDSVNLSQDALAEIRDVIARDFGTASLPDQPNAYTTKSKNAQEAHEAVRPTSALRTPAQVARFLSEDERRLYELIWRRAVACQMIPATLNTVSVDLSAGSEHVFRASGTTVVVPGFLAVYEEGKDTKSSEDEDEGRKLPLMKAGDNVPLDRIVTDQHFTQPPPRFTEAALVKALEEYGIGRPSTYASIIQTLQFRKYVEMEGRSFRPTDVGRAVSKFLSGHFTRYVDYDFTANLEDDLDAVSRGEAEWIPLMEKFWGPFKELVEDKKDSLDKTDAGSVRVLGTDPVSGKEVSARIGRFGPMVQIGTVEDEDKPTFASLRPGQSIYSISLEDALELFKMPRALGQDKDQDVSVGIGRFGPFARRGSTYASLKKEDDPYTIDLARAIFLIEEKEEIARNRVIKEFDGSDIQVLNGRFGPYISDGKLNGKIPKDREPASLTFEEVQQLLADTGKPVRKGFGAKKATLKKNTVKDSAPKKPAVKKTATKTAASKTAVKKAPAKKTATKKAAKRVVKKTVSKAAG
(504) DNA topoisomerase 1 [Xanthomonas albilineans GPE PC73]
1
MSKHLLIVESPAKAKTINKYLGKDFHVLASYGHVRDLIPKEGAVDPDDGFAMRYALIDKNEKHVDAIAKAAKAADDIYLATDPDREGEAISWHIAEILQERGLLKGKPLHRVVFTEITPRAIKEAMAHPRQIAGDLVDAQQARRALDYLVGFNLSPVLWRKVQRGLSAGRVQSPALRMIVEREEEIEAFLAREYWTIGAECAHPSQPFAAKLVKLDGQKFEQFTITDGATAEDARMRLQKAAQGALHVTDVTSKERKRRPAPPFTTSTLQQEASRKLGFTTSRTMRVAQKLYEGVTVGDEGTVGLISYMRTDSVNLSQDALVEIRDVIARDFGTGALPDKPNTYQTKSKNAQEAHEAIRPTSALRTPAQMAKYLDDDGRRLYELIWKRAVACQMVPATMNTVTVELAAGSEHSFRASGTTVIDPGFLAVYEEGKDQKAAEDEDEGRKLPAMKPGDRIPLDRIHADQHFTEPPPRYSEASLVKTLEEYGIGRPSTYASIIQTLMFRKYVELDARRFRPTDVGRAVSKFLSGHFTRYVDYDFTAKLEDDLDAVSRGEEEWRPLMEKFWGPFKELVEEKKESVDRSEATGARELGTDPKTGKPVSVRLGRFGPYAAIGSTAEDAEDKPKFASLRPGQSMHTITLEEALELFLMPRLLGQDKGDDVSVGIGRFGPFAKRGSVYASLKKEDDPYTIDLARAVFLIEEKEEIARNRIIKQFPDSDIQVLNGRFGPYISDGKLNGKIPKDREPSTLTLDEVQKLLEETGKPVRRGFGAKKVAAKKEAAPKKSPAKKTVADTPTKTAAKKAVKKATKKTVKKAVKKAAKKTVAKVAKGA
Family distribution
Taxonomy tree
Xanthomonadaceae