Selection 1

Selection 2

Selection 3

All selections

Taxon : Sphingomonadaceae

Informations

Name	Sphingomonadaceae
Rank	family
# topoisomerases	9

Lineage and sub-taxa

Lineage	Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Sphingomonadales > Sphingomonadaceae
Sub-taxa

Topoisomerases

Select all	Name	Family	Sequence
	(1848) DNA topoisomerase 1 [Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4 = ATCC 31821]	1	MKLVVVESPAKAKTIEKYLGSGYQVLASYGHIRDLPSKDGSVNPDNGFSMVWQNYPDKAHRLKAIEDAVKESDSLILATDPDREGEAISWHILELLKTKKLLPDDVERVTFNAITKAAVTDAMAHPRQLDNDLINAYLARRALDYLVGFTLSPILWRKLPGAKSAGRVQSVALRLVVDREQEIEGFKPQEYWSVEADMEADSIGFTSRLIQWRGQKLEKLSIADKTQAEAAQSDVESGHFTVSNVETKPVSRNPQPPFTTSTLQQEAARKLGFAASHTMRLAQSLYEEGLITYMRTDGVQMDESAIAAARKTITQRYDGGYVPDKPRQYQVKAKNAQEAHEAIRPTDFSRDKAASGDHARLYELIWKRALASQMASAKLERTTVDLTDGTGQNVLRVTGQVVLFSGFLTLYEESADDNANDRDGKEGRARLPLLRAGDAPLKKEVRADQHFTQPPPRYSEASLVKKMEDLGIGRPSTYASVIQVLKDRAYVTLERNRFIPSEAGRLLTAFLERFFERYVSYDFTAGLEDSLDEISGGRADWQKVLDAFWHDFKPKTAEVMEQQPSAITAELDKFLEPWLFPDKGDGHDPRECPSCHTGRLALKGGRFGAFIACSNYPECKYTRGFGQGEDGVDDNEPVLLGYMPENSDDDGYMAFSDQGDILPANTASASETGVTDGGIAANAAFSGKGNSASHTDRDDLPFDPDEPASSTGNVASSQSRMTGDETASSGNSRDSSAHGVSTTAGIDAESQAGISNQALAGKNNAGRTAVSDNKGNNSSSTIAAARKGGSTDDNATVSDPDGDIGSGASSSGQDADNRLLSHRNGDIDSRAIPADHKDSSSDQNASHALSPDRNSDDASVSNSDKKIDSKAVSTGHDVGNAITSDNSPSDNVAHLASTPSSATSSVKVALETENNDTAASKADEQAKEEEESRKARAVTRRTGRFGPYIQLGEGKNAKRVSVPRDVNPREVDFSLASRLLALPREIGLHPESGKMIIAGTGRYGPYLNCDGKYARLSSTEELLDIDIDRAVVKLAEAAQNKGRTGATLSREPLKVFGDSPVTEKPVQLMNGRYGPYVTDGETNASLPKDTTPESLTFEEALALLEARAKMPKKKKTKKAAAKKPAAKKTTTKKAAPKKATTKTATPKSATTDNATSEDGDATPAKSPAKKAVAKKTTAKKPASKSATKKAPSSKTTAAKKTSKATPKDEVAE
	(1847) DNA topoisomerase 1 [Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4 = ATCC 31821]	1	MKLVVVESPAKAKTIEKYLGSGYQVLASYGHIRDLPSKDGSVNPDNGFSMVWQNYPDKAHRLKAIEDAVKESDSLILATDPDREGEAISWHILELLKTKKLLPDDVERVTFNAITKAAVTDAMAHPRQLDNDLINAYLARRALDYLVGFTLSPILWRKLPGAKSAGRVQSVALRLVVDREQEIEGFKPQEYWSVEADMEADSIGFTSRLIQWRGQKLEKLSIADKTQAEAAQSDVESGHFTVSNVETKPVSRNPQPPFTTSTLQQEAARKLGFAASHTMRLAQSLYEEGLITYMRTDGVQMDESAIAAARKTITQRYDGGYVPDKPRQYQVKAKNAQEAHEAIRPTDFSRDKAASGDHARLYELIWKRALASQMASAKLERTTVDLTDGTGQNVLRVTGQVVLFSGFLTLYEESADDNANDRDGKEGRARLPLLRAGDAPLKKEVRADQHFTQPPPRYSEASLVKKMEDLGIGRPSTYASVIQVLKDRAYVTLERNRFIPSEAGRLLTAFLERFFERYVSYDFTAGLEDSLDEISGGRADWQKVLDAFWHDFKPKTAEVMEQQPSAITAELDKFLEPWLFPDKGDGHDPRECPSCHTGRLALKGGRFGAFIACSNYPECKYTRGFGQGEDGVDDNEPVLLGYMPENSDDDGYMAFSDQGDILPANTASASETGVTDGGIAANAAFSGKGNSASHTDRDDLPFDPDEPASSTGNVASSQSRMTGDETASSGNSRDSSAHGVSTTAGIDAESQAGISNQALAGKNNAGRTAVSDNKGNNSSSTIAAARKGGSTDDNATVSDPDGDIGSGASSSGQDADNRLLSHRNGDIDSRAIPADHKDSSSDQNASHALSPDRNSDDASVSNSDKKIDSKAVSTGHDVGNAITSDNSPSDNVAHLASTPSSATSSVKVALETENNDTAASKADEQAKEEEESRKARAVTRRTGRFGPYIQLGEGKNAKRVSVPRDVNPREVDFSLASRLLALPREIGLHPESGKMIIAGTGRYGPYLNCDGKYARLSSTEELLDIDIDRAVVKLAEAAQNKGRTGATLSREPLKVFGDSPVTEKPVQLMNGRYGPYVTDGETNASLPKDTTPESLTFEEALALLEARAKMPKKKKTKKAAAKKPAAKKTTTKKAAPKKATTKTATPKSATTDNATSEDGDATPAKSPAKKAVAKKTTAKKPASKSATKKAPSSKTTAAKKTSKATPKDEVAE
	(566) DNA topoisomerase 1 [Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444]	1	MQLVIVESPAKAKTIEKYLGPGYKVLASYGHVRDLPVKDGSVRPDEDFAMDWELYGDKQARVKAISDAAKGADRLILATDPDREGEAISWHVRELLAKRRVLPKEVERVTFNAITKQTVTDAMKKPRALDQDLIDAYLARRALDYLFGFTLSPVLWRKLPGAKSAGRVQSVALRLIVEREREIEAFRAQEYWSVIARLEHAGTEFAARLVKFDGQKLDKLTLGDEGAAMRAKGVVEAATFRVEEVETKPTRRNPYPPFTTSTLQQEAARKLGFSASHTMRVAQTLYEAGAITYMRTDGVQMDPSAISAARKAISDRYDGHYLPEKPRHYETKAKNAQEAHEAIRPTDFSKDRYGSADEARLYDLIYKRAMASQMASANIERTTVTLRDGTGKHELRATGQVVKFPGFLAVYEEGRDQKQDGDEEDGSLLPAMASGDTPAKRGVDATQHFTQPPPRYSEASLVKRLEELGIGRPSTYAATLQVLKDRNYVRTEKNRFFAEESGRLLTAFLERFFPRYVAYEFTAGMEEELDDVSGGRAEWKKVLADFWRDFKPKSDEVMEKKPSEVTAELDEFLSDYLFPPRADGTDPRLCPKCEEGRLSLRGGRYGAFVACSNYPECKYTRKFAQPGGADGDGGEDGALGKDPETGLEVVRKAGRFGPYIQLGDGKEAKRASIPKDIGELDLEWALKLLSLPREVGVHPETGNPITASIGRYGPYLAHDGKYARLKSTAEVFETGMNAAVMLLAAAAAGAGARGSRAAAEPLKVFGAHPTSGGEIKLMAGRYGPYVTDGTTNATLPRDKQPEALTLEEAITLIDERAAKGPAKGKKKAPAKKASAAKKPPAAKKAPAKKAAPKKAAAAE
	(619) DNA topoisomerase 1 [Sphingobium chlorophenolicum L-1]	1	MQLVIVESPAKAKTIEKYLGGDFHVLASYGHIRDLPAKDGSVDPDAGFAMQWENYGDKGKQLKAIADEAKKATRLILATDPDREGEAISWHVQEVLRAKKALPQKVDRVTFNAITKQAVTEAMAQPRALDEDLIDAYRARRALDYLVGFTLSPVLWRKLPGAKSAGRVQSVALRLVVEREREIESFVPQEYWSVAAEMEQGGQGFTARLVRWRGEKIERLTIGREGDAMAAKADVEAGRFTVEKVETKPVSRNPPPPFTTSTLQQEAARKLGFSASHTMRIAQQLYEDGAITYMRTDGVQMDGSAISAARKAIAERYDGGYLPEKPRQYQTKAKNAQEAHEAIRPTEFYRDKVGSGDHARLYDLIFKRALASQMASARLERTTIDLVDGTGQHGLRATGQVVIFPGFLALYEEGRDDTEDDDSKLLPRMAEGDAPAKKKVTAEQHFTQPPPRYSEASLVKKLEELGIGRPSTYASTLQVLKDRDYVRIEKNRFFAEESGRLVTAFLERFFERYVSYDFTAGLEEELDDISGGRAQWQAVLEAFWRDFKPKTTEVMEQKPSDITAELDKFLEPMLFPPKADGSNPRACPMCGDGQLSLRGGRFGAFIACSNYPECKYTRKFGQPGGKDGAEDSGPEVLGKHPETGQDIVRKSGRFGPYIEMGEGKEAKRGSIPKDLPDGEMTLDWAVKLLSLPREIGLHPETGKPIVANIGRFGPYLLHDGKYGRLSSTAEIFEVGMNSAVAKLADAANRGGRGASSREPLKVLGKHPRTEAEIKLMAGRYGPYVTDGTTNATLPKTIEQDALTLEEAAQLIDARAAAAPAKKGKKAPAKKAAAKKPAAKKAPAKKKVAAE
	(900) DNA topoisomerase 1 [Sphingobium sp. SYK-6]	1	MKLVIVESPAKAKTIEKYLGGDYRVLASYGHVRDLPPKDGSVDPEHGFAMAWENYGDKARQLKAITDEAKKADELILATDPDREGEAISWHVQEVLRAKKALPERVERVTFNAITKATITEAMKHPRALDDDLIDAYRARRALDYLVGFTLSPVLWRKLPGAKSAGRVQSVALRLIVEREREIEAFVSQEYWSVTALLEQGGQRFDARLVRWRGEKLDRLSIGKEGDALAAKADVEAGRFTVSSVETKPATRNPPPPFTTSTLQQEAARKLGLSASETMRVAQQLYEDGAITYMRTDGVQMDESAISAARNAIAKRYDGGYLPDKPRHYQTKAKNAQEAHEAIRPTDFSRESAGSGVHAKLYDLIFKRALASQMASARLERTAVELTDGTGQHVLRATGQVVLFPGFLALYEEGRDDPVGRQGAGDGEDEESRLLPALKAGDQPAKKDVRADQHFTQPPPRYSEASLVKRLEELGIGRPSTYASTIQTLKDRDYVRIEKNRFFAEESGRLVTAFLERFFERYVSYDFTAGLEEELDEISGGRAQWQQVLEAFWRDFKPKTAEIMEQKPSEITAALDEYLAPMLFPDKGDGSDPRLCPLCHDGRLSLRGGRYGAFIACSNYPECRYTRKFGQPGGADGDAAGGNEELGTHPETGEPILRKSGRFGPYVEMGSGKEAKRASIPKDLPNGELTLDWATRLLSLPRTIGDHPETGKPITASLGRYGPYLAHDGKYARLASTAEIFETGMNAAVAKLADAANRGGARKAAEPLKILGAHPRTEAEIRLMEGRYGPYVTDGTTNATLPKTVAPDALTLEEAAQLIDERAAKAPAGKRKGKAKSSAGKSGAAKKTTVKGKAPSKAKSKAPAAAE
	(138) DNA topoisomerase 1 [Sphingobium japonicum UT26S]	1	MQLVIVESPAKAKTIEKYLGGDFHVLASYGHIRDLPPKDGSVDPDNGFAMSWENYGDKGKQLKAIADEAKKATRLILATDPDREGEAISWHVQEVLRAKKALPQKVDRVTFNAITKQAVTEAMAQPRALDEDLIDAYRARRALDYLVGFTLSPVLWRKLPGAKSAGRVQSVALRLVVEREREIESFVPQEYWSVAAEMEQAGQGFTARLVKWRGEKIERLTIGREGDAMAAKADVEAGRFTVEKVETKPVSRNPPPPFTTSTLQQEAARKLGFSASHTMRIAQQLYEDGAITYMRTDGVQMDGSAISAARKAIAERYDGGYLPEKPRQYQTKAKNAQEAHEAIRPTEFYRDKVGSGDHARLYDLIFKRALASQMASARLERTTVDLVDGTGQHGLRATGQVVIFPGFLALYEEGRDDPERGSGKHASADGEDDDSKLLPRMAAGDAPAKRKVTAEQHFTQPPPRYSEASLVKKLEELGIGRPSTYASTLQVLKDRDYVRIEKNRFFAEESGRLVTAFLERFFERYVSYDFTAGLEEELDDISGGRAQWQAVLEAFWRDFKPKTAEVMEQKPSDITAELDKFLEPMLFPPKADGSNPRACPMCGDGQLSLRGGRFGAFIACSNYPECKYTRKFGQPGGDKDGEDTGPEVLGQHPETGQDIVRKSGRFGPYIEMGEGKEAKRGSIPKDLPDGELTLDWAVKLLSLPREIGPHPETGKPIVANIGRFGPYLLHDGKYGRLSSTAEIFEVGMNSAVAKLADAANRGGRGASSREPLKVLGKHPRTEAEIKLMAGRYGPYVTDGTTNATLPKTIEQDALTLEEAAQLIDARAAAAPAKKGKKAVAKKAGAKKPAAKKAPAKKKVAAE
	(1017) DNA topoisomerase 1 [Sphingopyxis alaskensis RB2256]	1	MQLVIVESPAKAKTIEKYLGRDFKVLASYGHVRDLPPKDGSVDPDDGFAMQWQLYPDKAKRLKEISDAAKGADRLILATDPDREGEAISWHVQELLRSKKALPAAVDRVTFNAITKQAVTDAMRHPRELDTDLIDAYRARRALDYLVGFTLSPVLWRKLPGAKSAGRVQSVALRLVVEREREIEAFVAQQYWSVTGLFEMGGTPFKARLSRWRGDKIERLSITSEADARAAEADVKAGHFTVDTVETKPLTRNPPPPFTTSTLQQEAARKLGFSASHTMRIAQALYEDGAITYMRTDGVQMDGSAISAARKAIATRYDGGYVPDKPRQYQTKAKNAQEAHEAIRPTDFGKDKVGGGDHARLYELIWKRALASQMASARLERTSVELSDGTGKTTLRATGQVVKFPGFLALYDEGRDDAEDEDARLLPAMAKGDAPAKTGVEVERHETQPPPRYSEASLVKKMEELGIGRPSTYASILQVLKDRDYVRVEKNRFIPEESGRLLTAFLERFFERYVGYDFTAELEEELDDVSGGRAQWQAVLERFWRDFKPRTGEVMEQKPSEITAALDEFLGPYLFPDKSDGSDPRLCPNCGTGRLALRGGKFGPFIACSNYPDCKFTRKFAQSGGNGEADNGPETLGTDPESGLEVTKRSGRFGPYIQLGEGSEAKRSSIPKDIPAEDFDLDYALRLLSLPREVGVHPESGKPIMAGLGRYGPYLLHDGKYAKLGGTAEIFDIGMNAAVVRIAEAANGGGRGRAKAEPLNTFGPHPTSGGEMKLMEGRYGPYVTDGTTNATLPKTTDPATLTMEEAIALIDARAAKGPVKGKKKAAPKKKAAAKKAAAKEAPARKTAAE
	(796) DNA topoisomerase 1 [Novosphingobium sp. PP1Y]	1	MQLVIVESPAKAKTIEKYLGKDFKVLASYGHVRDLPPKDGSVRPDEGFEMDWELYGDKQKQVRAITDAAKVSDRLILATDPDREGEAISWHVLELLKKRRALPKDVQRVTFNAITKDTVTKAMQAPRELDQDLIDAYLARRALDYLFGFTLSPVLWRKLPGAKSAGRVQSVALRLIVDREREIEAFRPQEYWSVAAHMEQDGTPFTAKLVAFEGQKLDRLSLGDEGIAMRAKAAVEQGAFKVENVETKPHRRNPQPPFTTSTLQQEASRKLGFSASQTMRVAQSLYEAGAITYMRTDGVQMDPSAISACRKAISDRYDGHYLPEKPRHYETKAKNAQEAHEAIRPTEFTRDRFGSGDEARLYDLIFKRAMASQMASAALERTTITLRDGTGRNELRATGQVVKFPGFLAVYEEGRDQKDDDEESGLLPMMRSGDAPAKKDVTAEQHFTQPPPRFSEASLVKRLEELGIGRPSTYAATIQVLKDRNYVRTEKNRFFAEESGRLLTAFLERFFERYVAYDFTAGMEEELDDVSGGRHAWKELLEAFWRDFKPKSDEVMERKPSEVTEVLDEFLSDYLFPPKDDGSDPRACPKCADGRLALRGGRYGAFVACSNYPECKFTRKFAQPGGNGETADDEELGKHPETGEEITRRVGRFGPYIQLGEGKEAKRASIPKDIDELTLDWALKLLSLPREVGKHPETGKEIVANIGRYGPYLLHDGKYGKLRSTADVFETGMNAAVSILAEAAQGGGRGQRAKAEPIKVLGKHPTSEGEIKVLAGRYGPYVTDGTTNATLPRDQKPEELTAEQAIALIDAKAAKGPAKGKKKASAKKAPAKKATAKKAAGKSGEAKTATKKAPARKASVTKTSNDTSEQDGEVPWDVDA
	(1221) DNA topoisomerase 1 [Sphingomonas wittichii RW1]	1	MKLVVVESPAKAKTIEKYLGPGHRVLASYGHVRDLPAKDGSVDPDNGFAMEWEAYADKSRQLKAIADEAKGADTLILATDPDREGEAISWHVKEVLGKRRVLPKDVRRVTFNAITKAAVTEAMANPRDLDEDLIDAYRARRALDYLVGFTLSPVLWRKLPGAKSAGRVQSVALRLVVDREREIELFKAQEYWSVTADMEYDGIGFLTRLVRWKGQKIDRLTIGNGKDAEAAKADVEAGRFTVASVETKPLTRNPPPPFTTSTLQQEAARKLGFSASHTMRIAQALYEDGAITYMRTDGVQMDGSAISAARGAIANRYDASYVPDKPRQYSAKAKNAQEAHEAIRPTDFSRDRAGSGDHGRLYDLIFKRALASQMASARLERTTVDLVDGTGQNALRATGQVVLFPGYLALYEEGRDDPNPQGQQAGGGDADEDSRRLPRMKEGDSPAKKKVDAEQHFTQPPPRYSEASLVKKMEELGIGRPSTYASILQTLKDRDYVTVEKNRFTPNESGRLVTSFLERFFERYVSYDYTAHLEEELDDVSGGRAGWQQVLEAFWKDFKPKTAEVMDQKPSEVTAALDEFLAPYLFPDKGDGTDPRLCPVCQEGRLSLRGGRFGAFIACSNYPECKFTRRFAQAGAANDGADTGPVVIGTDPATGLEVSKRAGRFGPYIQLGDGKDAKRSSIPKDVLGDDLDLGWALKLLSLPRLIGPHPETGHPITASIGRFGPYLAHDGKYARLGSTAEVFETGMNAAVVKLAEAANGGGRQRGKAEPLKTFGASPVTGSEVKLMAGRFGPYVTDGETNATLPKTANPDELTAEAALELLAARAAKGPPAKGKKKAPAKKAAPKKAAAKK

Family distribution

Taxonomy tree

Sphingomonadaceae